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提取变量中具有唯一值的行的所有可能组合 - Extract all possible combinations of rows with unique values in a variable

我正在尝试对一个数据集进行荟萃分析,其中多个作者进行了多项研究,这可能会导致偏差。 因此,我想提取所有可能的行组合,其中任何Author都出现一次。 样本数据: 并希望提取每个作者出现一次的所有可能的行组合(在本例中为 4 种可能性)。 最后,我将对这 4 个不同的提取数据帧进行分析,但我不知道如何 ...

在 Metafor Forestplot 中拟合一长串研究以使其可读 - Fitting a long list of studies in Metafor Forestplot to make it readable

我正在尝试使用 metafor::forest 做一个森林 plot。 问题是因为我有超过 100 项研究,所以 output 是不可读的,因为行混合在一起并重叠,除非我选择非常小的字体(在这种情况下你也无法阅读它)。 关于如何 plot 的任何想法,以便字体足够大以便在所有行不重叠的情况下阅读? ...

meta包计算的95%置信区间和SE与原始数据不同 - 95% confidence intervals and SE calculated by meta package are different from the original data

我的愿望是使用 meta r 包的森林函数在森林图中呈现 OR 和 95% 置信区间。 这是一项非荟萃分析任务。 但是,当在森林图中绘制时,提供的置信区间会发生变化。 例如,您可以看到以下内容 运行上面的代码后,我得到以下图。 如您所见,计算出的 seTE(标准误差)与您使用公式 SE =(上限 ...

如何创建一个漏斗 plot,其中相同的颜色表示来自相同研究的效应大小 - How to create a funnel plot where the same color indicates effect sizes from the same studies

我正在尝试在 metafor 中创建一个funnel plot metafor测试是否存在发表偏倚。 在漏斗 plot 中,我试图创建相同的颜色来指示来自相同研究的效果大小。 我最近看到一篇论文,他们使用以下代码应用了相同的方法: 我只是想知道inferno(25)[pos]在参数col中意味着什么 ...

2022-11-30 16:03:05   1   19    r / metafor  
如何更改森林 plot 中的点? - How to change dots in forest plot?

我有一个 excel 表,其中包含我研究的不同疾病的优势比数据。 我想用 R package ggplot2 制作森林图。我用过这个脚本: 这为所有疾病制作了圆形黑点。我想将图表上的点的形状更改为正方形或其他不同形式,但仅限于某些疾病。 我想更改图表上对应于第 6、8、14 和 16 行的点的形状 ...

如何解释稳健性结果 - how to interpret robustness result

我使用 metafor 运行了一个多元元分析来解释效应大小的依赖关系,然后我还使用metafor的robust metafor应用了稳健性检查。 但是,我不确定我应该如何解释这种稳健性检查的结果。 有人能帮忙吗? 以下是多元荟萃分析的结果 这是稳健性检查的结果 ...

使用 metafor package 生成的森林图注释中的小数位数 - Decimal places in annotations of forest plots generated with the metafor package

在之前一篇关于使用 metafor package 生成的森林图中显示的有效数字的文章中,建议使用选项digits来指定 x 轴的刻度标记标签和 plot 注释的小数位数。 是否可以为注释的不同部分指定不同的小数位数,即权重为 1 位小数,效应大小为多于 1 位小数,如果可以,如何? ...

总结期间的错误:要估计的参数数大于观察数 - Error during wrapup: Number of parameters to be estimated is larger than the number of observations

我正在metafor package 中运行元回归分析,我的代码如下 当我运行此代码时,出现以下错误 但是当我从 model 中删除“annual_temp”时,它运行完美。 我不确定是什么问题。 “annual_temp”是一个连续变量。 您能否建议我如何解决此错误? 提前致谢 ...

当每个作者在数据中有多行时在 metafor 中使用 predict - Using predict in metafor when each author has multiple rows in the data

我正在使用 metafor package 进行元分析,我对 X 对年龄对栖息地利用的影响(原始平均值和方差)的影响感兴趣。 我的一个模型的一个例子是: 我不使用 Citation 作为随机效应的理由是,与random = list( ~ 1 | Citation/ID, ~ 1 | Region ...

荟萃分析中的 ClubSandwich::conf_int - SE 公式没有给出相同的 CI - ClubSandwich::conf_int in meta-analysis - SE formula does not give the same CIs

所以我使用 metafor (rma.mv) 和 clubSandwich 来计算 CHE 模型元分析,但是当我使用 clubSandwich::conf_int 函数来估计我的集群稳健的 SE 和 CI 时,我注意到 CI 中存在一些差异。使用 SE 以通常的方式计算它们(lnOR +/- (1. ...

metafor:Forest 移除或移动 metaestimate 列 - metafor:Forest removing or moving metaestimate column

我正在尝试更改我的森林图的格式以准备出版。 我想移动显示当前效果估计的最右侧列(在我的情况下为优势比)。 该列是固定在图的右侧还是可以移动以使其与其他列对齐并且森林图本身位于最右侧。 这是我当前的森林情节代码 这给出了这个情节 我想将 ODDS RATIO 列移动到 diff[95 CI] ...

R从函数返回部分(不完整)结果 - R returns partial (incomplete) results from function

我尝试比较使用包metafor (rma.mv- 或 rma - 函数)计算的元分析中的模型。 我尝试编写一个函数,从i模型中提取特定值(这里:只是 beta 和标准错误)并将它们添加到数据框中。 我的问题是模型结果最终不会作为数据或数据框。 标题重复每一行。 当我将结果转换为对象并尝试调用它时, ...


 
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