使用awk / grep从数据库中提取＃，过滤

Question

我有一个大型制表符分隔的数据库，看起来像：

1       14933   14933   G       A       ID=COSN404397;OCCURENCE=1(lung)  
1       14948   14948   G       A       ID=COSN415697,COSN415698;OCCURENCE=2(urinary_tract)  
1       69537   69537   G       T       ID=COSM536198;OCCURENCE=1(lung)  
1       69538   69538   G       A       ID=COSM75742;OCCURENCE=1(ovary)  
...

我正在尝试使用awk或grep仅保留OCCURENCE> = 3的行（是的，它在整个数据库中拼写错误！），但是我似乎无法弄清楚如何最好地分割/扫描第六列...

Answer 1

这种短的单线应该为您工作。 顺便说一句，您当前的示例没有OCCURENCE>=3任何行:)

 awk -F'OCCURENCE=|\\(' '$2>=3' file

好吧...如果有点打高尔夫球.... (=是关键...：D

awk -F'[(=]' '$3>2' file

Answer 2

尝试这个：

$ awk -F\; '{ if (substr($2,11,index($2,")")) >= 3) print $0; }' x.txt

Answer 3

缩短一根衬里仍可保持FS可用：

$ awk -F'[(=\t;]' '$9>2' file