在IPython中释放巨大的numpy数组的内存

Question

更新： - 这个问题在机器重启后解决了。 还没有弄清楚为什么之前发生这种错误。

我有一个函数加载一个巨大的numpy数组（~980MB）并返回它。

当我第一次启动Ipython并调用此函数时，它会将数组加载到变量中而没有任何问题。

但是，如果我再次运行相同的命令，它将退出提出“内存错误”。

我试过以下，

del hugeArray

仍然发生同样的错误。 我甚至尝试了以下内容

del hugeArray
gc.collect()
gc.collect()

最初， gc.collect()返回145并且第二次调用返回48.但即使在此之后我调用该函数时，仍然会引发内存错误。

我可以再加载的唯一方法是重启ipython。 我可以做些什么来释放ipython中的所有内存，以便我不必重新启动它？

----------------更新

以下是%whos的输出

Variable   Type      Data/Info
------------------------------
gc         module    <module 'gc' (built-in)>
gr         module    <module 'Generate4mRamp' <...>rom 'Generate4mRamp.pyc'>
np         module    <module 'numpy' from '/us<...>ages/numpy/__init__.pyc'>
plt        module    <module 'matplotlib.pyplo<...>s/matplotlib/pyplot.pyc'>

除此之外，gr是我的模块，包含我用来加载数据立方体的函数。

---------如何重现错误

以下简单函数能够重现错误。

import numpy as np
import gc

def functionH():
    cube=np.zeros((200,1024,1024))
    return cube

testcube=functionH()   #Runs without any issue 

del testcube
testcube=functionH()  # Raises Memory Error

del testcube
gc.collect()
gc.collect()
testcube=functionH()  # Still Raises Memory Error

此错误仅在Ipython中发生。 在给出del testcube之后的简单python（>>>）中，没有内存错误。

Answer 1

你在看价值吗？ IPython将输出变量缓存为例如Out[8] ，因此如果你检查它，它将被保存在内存中。

您可以执行%xdel testcube删除变量并将其从IPython的缓存中删除。 或者， %reset out或%reset array将清除所有输出历史记录，或仅清除对numpy数组的引用。