“ mpirun无法启动指定的应用程序，因为它找不到可执行文件”错误

Question

我遇到了一个阶段性问题，该问题可以解决，但现在没有解决。

我在两台计算机之间运行带有tau分析的OpenMPI程序。 看来mpirun无法在远程主机上运行tau_exec程序，也许是权限问题？

 cluster@master:~/software/mpi_in_30_source/test2$ mpirun -np 2 --hostfile hostfile -d           tau_exec -v -T MPI,TRACE,PROFILE ./hello.exe
 [master:19319] procdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@master_0/4568/0/0
 [master:19319] jobdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@master_0/4568/0
 [master:19319] top: openmpi-sessions-cluster@master_0
 [master:19319] tmp: /tmp
 [slave2:06777] procdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@slave2_0/4568/0/1
 [slave2:06777] jobdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@slave2_0/4568/0
 [slave2:06777] top: openmpi-sessions-cluster@slave2_0
 [slave2:06777] tmp: /tmp
 [master:19319] [[4568,0],0] node[0].name master daemon 0 arch ff000200
 [master:19319] [[4568,0],0] node[1].name slave2 daemon 1 arch ff000200
 [slave2:06777] [[4568,0],1] node[0].name master daemon 0 arch ff000200
 [slave2:06777] [[4568,0],1] node[1].name slave2 daemon 1 arch ff000200
 [master:19319] Info: Setting up debugger process table for applications
   MPIR_being_debugged = 0
   MPIR_debug_state = 1
   MPIR_partial_attach_ok = 1
   MPIR_i_am_starter = 0
   MPIR_proctable_size = 2
   MPIR_proctable:
     (i, host, exe, pid) = (0, master,      /home/cluster/software/mpi_in_30_source/test2/tau_exec, 19321)
     (i, host, exe, pid) = (1, slave2,      /home/cluster/software/mpi_in_30_source/test2/tau_exec, 0)
 --------------------------------------------------------------------------
 mpirun was unable to launch the specified application as it could not find an executable:

 Executable: tau_exec
 Node: slave2

 while attempting to start process rank 1.
 --------------------------------------------------------------------------
 [slave2:06777] sess_dir_finalize: job session dir not empty - leaving
 [slave2:06777] sess_dir_finalize: job session dir not empty - leaving
 [master:19319] sess_dir_finalize: job session dir not empty - leaving
 [master:19319] sess_dir_finalize: proc session dir not empty - leaving
 orterun: exiting with status -123

在slave2上：

cluster@slave2:~/software/mpi_in_30_source/test2$ tau_exec -T MPI,TRACE,PROFILE ./hello.exe
hello MPI user: from process = 0 on machine=slave2, of NCPU=1 processes
cluster@slave2:~/software/mpi_in_30_source/test2$ which tau_exec
/home/cluster/tools/tau-2.22.2/arm_linux/bin/tau_exec

因此，两个节点上都有一个正常工作的tau_exec。 当我在没有tau_exec的情况下运行mpirun时，一切正常。

cluster@master:~/software/mpi_in_30_source/test2$ mpirun -np 2 --hostfile hostfile  ./hello.exe
hello MPI user: from process = 0 on machine=master, of NCPU=2 processes
hello MPI user: from process = 1 on machine=slave2, of NCPU=2 processes

Answer 1

曾经有这样的错误，当我尝试命名输出文件时，请尝试使其保持不变

    mpirun -n <number> a.out

这就是对我有用的方法！

Answer 2

可能是因为您已经安装了openMPI而不是MPICH2，所以您应该以root用户身份运行以下命令：

root〜 ＃ update-alternatives --config mpirun

替代mpirun有2个选择（提供/ usr / bin / mpirun）。

选择| 路径| 优先| 状态

• * 0 | /usr/bin/mpirun.openmpi | 50 | 自动模式
• 1 | /usr/bin/mpirun.mpich2 | 40 | 手动模式
• 2 | /usr/bin/mpirun.openmpi | 50 | 手动模式

按Enter保留当前选择[*]，或键入选择编号： 1

然后，应选择上述的MPICH版本以正常运行。

Answer 3

如果您正在使用mpirun运行Shell脚本，请确保已使用chmod +x script_file.sh否则将看到此错误。

Answer 4

尝试在命令行中将完整路径放入tau_exec 。 您的PATH可能在所有节点上都不相同。 如果是这种情况，它将无法在路径不正确的任何地方找到可执行文件。

这很可能不是权限问题，但是我不记得Open MPI中的所有错误消息来告诉您它们可能有多有用。