glmmadmb错误：超过200个最大因变量

Question

我需要拟合一个具有约500个固定效果的模型。

nb.xx.ff <-glmmadmb(count~Pint-1, 
                    data=dnoNM,
                    family="nbinom")

并得到了以下错误：

## maximum number of depdendent variables of 200 exceeded 
## use gradient_structure::set_NUM_DEPENDENT_VARIABLES(int i);
## to increase the number of dependent variables
## Error in glmmadmb(count ~ Pint - 1, data = dnoNM, family = "nbinom", zeroInflation = TRUE,  : 
##   The function maximizer failed (couldn't find STD file)
## changed working directory to /spin1/users/swihartbj/projects/_SMFA/Pxs_2015_ctrls_only/Rnw/Final/_ilmn5 
## removed temp directory /scratch/Rtmp/Rtmp4iDtvH/glmmADMB2384f4030d4a1 

有没有办法从R调用中增加这一点？

Answer 1

是。

根据此处的建议，将“ -ndv 3000”添加到extra.args 。 只要固定效果的数量是唯一的问题，并且列出的数量（在此示例中为3000）大于固定效果的数量，那么这应该起作用：

nb.xx.ff <-glmmadmb(count~Pint-1, 
                    data=dnoNM,
                    family="nbinom",
                    extra.args="-ndv 3000")