在python中创建Dataframe，将其作为参数传递给R中的函数，但是dataframe列不可访问。 使用RPy2

Question

python函数中的输入值如下所示。 在每次迭代中（将在R中访问），将input_X的键存储为“ 0”和“ 1”，将其转换为dict。

Y = [1,1,1,1,1,1,0,0,0,0,0,0]
input_X = [[3,4,3,4,3,1,5,4,6,7,5,3], [4,5,6,5,4,5,6,7,8,7,8,7]]
X = {}
    for i in range(len(input_X)):
        X[str(i)]=input_X[i]

X更改为R Dataframe：

RX = robjects.DataFrame(X)

它调用R函数：

    r('''
           source('r_test.r')
    ''')
    r_getname = robjects.globalenv['logistic_regression']
    x=r_getname(RY,RX)
    return str(x)

现在来到R：

logistic_regression = function(y,x){
    print(x["1"])
}

给出错误，指出列“ 1”不存在。 那么解决这个问题的正确方法是什么？

Answer 1

您的代码中有两个问题。 首先，您需要先将python数组转换为R个整数向量。 例如：

import rpy2.robjects as robjects

Y = [1,1,1,1,1,1,0,0,0,0,0,0]
input_X = [[3,4,3,4,3,1,5,4,6,7,5,3], [4,5,6,5,4,5,6,7,8,7,8,7]]
X = {}
    for i in range(len(input_X)):
        X[str(i)]=robjects.IntVector(input_X[i])

robjects.r('''
logistic_regression = function(x){
    print(colnames(x))
}
''')

xr = robjects.DataFrame(X)
robjects.r.logistic_regression(xr)

其次，请注意，这会打印X0和X1，而不是0和1，因为在构造函数中，如果没有check.names = F，列名就不能以数字开头（但是Rpy2 DataFrame函数中不存在此参数）。