igraph的数据处理

Question

我的目标是按组将行转换为组合，以便使用igraph。

示例我想从这里去：

start  <- data.frame(id = c(2,3,5,6),
            group_a = c("A","A","b","b"))

对此：

end <- data.frame(src = c(2,5),dst=c(3,6))

稍微说明一下，因为“ A”具有2和3然后2连接到3，“ b”具有5和6然后5连接到6

我尝试进行内部联接，但最终遇到了所有交互：

sqldf("select a.id as src ,
              b.id as dst
      from start a   
      inner join start b on a.group_a = b.group_a")

我还检查了igraph上的一些文档，以查看是否有直接执行此功能的函数，但是我似乎找不到能起作用的东西。 我尝试了这个：

library(igraph)
g <- graph.data.frame(start)
get.edgelist(g)

谢谢

Answer 1

我找到了使用dplyr的解决方案

start %>% group_by(group_a) %>% do(data.frame(t(combn(.$id, 2))))