根据bash中的特定列过滤大文件

Question

我有一个> 100米行的文件，并希望按以下标准过滤它：

$ wc -l s1bam.bed 
104797540 s1bam.bed

$ head -n 3 s1bam.bed 
chr1    14688   14979   NB501800:50:H3NW5BGX3:2:22310:19560:5036/1  3   +
chr1    14688   14979   NB501800:50:H3NW5BGX3:3:13501:3458:17919/1  3   +
chr1    14727   15018   NB501800:50:H3NW5BGX3:2:22310:19560:5036/2  3   -

我想输出的是第五个字段值>=20和!=255 （例如右边的第二个字段）。 如何在Bash中实现它？

Answer 1

您可以使用awk：

awk '$5 >= 20 && $5 != 255' file