计算R中数据帧中每列的百分位数

Question

我有一个包含3个分类列和40个数值的数据集。 我想计算出40个数字列中每个列的第90个百分位数。

将此数据框作为可重现的示例：

fruit = c("apple","orange","banana","berry") #1st col
ID = c(123,3453,4563,3235) #2nd col
price1 = c(3,5,10,20) #3rd col
price2 = c(5,7,9,2) #4th col
price3 = c(4,1,11,8) #5th col

df = data.frame(fruit,ID,price1,price2,price3) #combine into a dataframe

我想做类似的事情： calc_percentile = quantile(df[,3:5], probs = 0.90)

我正在寻找的输出将是：

# Column  90thPercentile
# price1  17
# price2  8.4
# price3  10.1

鉴于我有40列，这样做是不切实际的。 非常感谢您的帮助！

Answer 1

stack(lapply(df[3:5], quantile, prob = 0.9, names = FALSE))
#  values    ind
#1   17.0 price1
#2    8.4 price2
#3   10.1 price3

Answer 2

使用dplyr和tidyr ：

df %>%
 summarise_at(3:5, ~ quantile(., probs = 0.9)) %>%
 gather("Column", "90thPercentile")

  Column 90thPercentile
1 price1           17.0
2 price2            8.4
3 price3           10.1