从 R 问题调用 Julia

Question

我正在使用 Julia 1.0.0 和 R 3.5.1，我在使用JuliaCall和XRJulia从 R/RStudio 调用 Julia 时遇到问题。

当我尝试：

library(JuliaCall)
julia <- julia_setup(JULIA_HOME = "C:\\Program Files\\Julia-1.0.0\\bin")

找到了 Julia 版本，但弹出一条错误消息说“缺少 libgcc_s_seh-1.dll”

当我尝试：

library(XRJulia)
JULIA_BIN <- "C:\\Program Files\\Julia-1.0.0\\bin"
findJulia(test=TRUE)

测试返回 false。

但是，当我使用RCall从 Julia 调用 R 时，Julia 可以定位并使用 R（使用 Atom/Juno IDE）。 Julia 和 R 都位于 C:\\Program Files 路径中。

从 R/RStuio 调用 Julia 的正确方法是什么？

我在这里寻找解决方案，但无法使其正常工作。

更新 - 我尝试了这个解决方案，以便 R 可以识别 Julia 文件所在的位置。 当我重新启动我的会话并设置新的 env 然后尝试运行我的 R 会话下面的代码时，它会中止

Sys.setenv(PATH = paste(Sys.getenv("PATH"),"C:\\Program Files\\Julia-1.0.0\\bin",sep=";"))
library(JuliaCall)
julia <- julia_setup(JULIA_HOME = "C:\\Program Files\\Julia-1.0.0\\bin")

Answer 1

（这是关于 Julia 的 dll 问题的更通用的建议。如果我安装了 R，我会尝试确切的情况。）

Windows SetDllDirectory问题

我在 PyInstaller 调用另一种语言时遇到了类似的问题。 它最终与 PyInstaller 中对SetDllDirectory的调用有关，该调用以一种奇怪的方式修改了搜索路径。

https://docs.microsoft.com/en-us/windows/win32/api/winbase/nf-winbase-setdlldirectorya

https://github.com/pyinstaller/pyinstaller/wiki/Recipe-subprocess#windows-dll-loading-order

要修复它，我只需要告诉 python 将SetDllDirectory重置回NULL 。 我不完全确定 R 中的等价物。

SysInternals ListDlls

在调试正在加载的 dll 时，我非常喜欢 SysInternals 提供的这个工具。 下载它，并在julia或R运行时使用ListDlls.exe julia或ListDlls.exe R运行它。

https://docs.microsoft.com/en-us/sysinternals/downloads/listdlls

R dyn.load文档

如果您加载 3rd 方 dll，尤其是在 Windows 上，这听起来也像是 R 会尝试做很多事情来查找 dll。

https://www.rdocumentation.org/packages/base/versions/3.6.2/topics/dyn.load

“加载 DLL 的标准机制”包括查找 DLL 的位置的搜索顺序（如果没有以绝对路径的形式给出，这是首选），以及将找到其依赖 DLL 的位置。 此搜索路径取决于 Windows 版本及其安全设置，但对于自 Windows XP SP1 起的版本，它是

• 启动应用程序的目录。

• 各种系统目录，例如c:/Windows/system32 、 c:/Windows/system和c:/Windows 。

• 当前目录。

• 沿着环境变量PATH给出的可执行文件的搜索路径。

包通常希望在其libs目录中提供依赖 DLL，并通过设置PATH变量来实现（在 R 的最新版本中library.dynam会自动执行此操作），但 DLL 搜索顺序意味着 DLL 位于启动目录和系统目录中将是首选。 在 Windows XP SP1 和更高版本上，有一种方法可以修改搜索顺序。 如果参数DLLpath提供给dyn.load ，后者使用 Windows 系统调用SetDllDirectory在第二位插入DLLpath的值，并在该dyn.load调用期间删除当前目录。 （注意这种方式只能插入一个目录。）

用户一直被诸如此类的消息所迷惑

error: unable to load shared object '.../library/rJava/libs/x64/rJava.dll': LoadLibrary failure: The specified module could not be found.

最后一行是 Windows（不是 R）诊断：找不到的“模块”不是rJava.dll而是 Windows 正在寻找的其他东西（这里很可能是 Java DLL）：如果幸运的话，会有一个对话框包含更多详细信息的框。

Julia 如何加载 Sys.dll

Julia 1.x 当前从 exe 位于bin/的文件夹中加载一些 dll， sys.dll从附近的文件夹中加载sys.dll ： ../lib/julia/sys.dll 。 您可以通过在调用 julia 时使用-J参数指定sys.dll位置来覆盖它。

希望有帮助。