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在未来使用glmnet

using glmnet with future

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在Windows上,我在使用library(doparallel)遇到困难,它在几次glmnet调用后似乎崩溃了

因此,我正在尝试将future软件包( https://github.com/HenrikBengtsson/future )与glmnet但是我不确定在此处进行操作的最佳方法是什么。

这是一个简单的示例(非并行化)

X = matrix(rnorm(1e4 * 200), 1e4, 200)
Y = rnorm(1e4)
system.time(cv.glmnet(X, Y))
user  system elapsed 
3.42    0.22    3.67 

我如何使用Future来使用我的所有4个核心(在我的本地计算机上-没有像在R中并行执行glmnet那样的分布式集群)

谢谢!

1 个回复

这似乎有效。 至少用户时间要短得多,但是由于并行开销而增加了系统时间。

library("doFuture")
registerDoFuture()
plan(multiprocess, workers = 4L)

system.time(cv.glmnet(X, Y, parallel = TRUE))

user  system elapsed 
0.46    0.17    5.59 

versus

system.time(cv.glmnet(X, Y))
   user  system elapsed 
   2.33    0.05    2.39 
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