翻转基础R中的热图的颜色范围

Question

我正在基地R中构建一个简单的热图。这是我的矩阵：

stleft = matrix( 
     c(0,5,5,2,6,8,4,6,9), 
     nrow=3, 
     ncol=3) 
colnames(stleft) <- c("Narrow","Wide", "Wider")
rownames(stleft) <- c("Person", "Object","Bare")
stleft

矩阵看起来像这样：

> stleft
       Narrow Wide Wider
Person      0    2     4
Object      5    6     6
Bare        5    8     9

要构建热图，我只需运行：

heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none")

如您所见，“0”（对应于窄/人单元格）显示为深红色，而“9”（对应于较宽/裸细胞）显示为浅黄色。

• 如何“翻转”此范围，使“0”以浅色显示，“9”以深色显示？

• 为什么图像会被截断？ 它似乎在RStudio绘图面板中被截断，并被保存截断。 我试图扩大R Studio中的情节面板无济于事。

Answer 1

heatmap() （和image() ）默认使用heat.colors()来生成颜色。 如果需要，你可以提供自己的颜色，f.ex。 通过使用heat.colors() ，刚刚逆转。

par(oma=c(3, 0, 0, 3))
col <- rev(heat.colors(999))
heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none", col = col)