热图不显示

Question

我试图从一个看起来像这样的数据框中绘制一个简单的热图：

   row column content amount
0    x      a      c1      1
2    x      b      c3      3
4    x      c      c2      1
6    y      a      c1      1
8    y      b      c3      3
10   y      c      c2      1
12   z      a      c1      1
14   z      b      c3      3
16   z      c      c2      1

row和column指示单元格的位置，应根据content选择其颜色，我希望工具提示显示content和amount 。

我目前尝试这样（使用bokeh 1.2.0）：

import pandas as pd

from bokeh.io import show
from bokeh.models import CategoricalColorMapper, LinearColorMapper, BasicTicker, PrintfTickFormatter, ColorBar, ColumnDataSource
from bokeh.plotting import figure
from bokeh.palettes import all_palettes
from bokeh.transform import transform

df = pd.DataFrame({
    'row': list('xxxxxxyyyyyyzzzzzz'),
    'column': list('aabbccaabbccaabbcc'),
    'content': ['c1', 'c2', 'c3', 'c1', 'c2', 'c3'] * 3,
    'amount': list('123212123212123212')})

df = df.drop_duplicates(subset=['row', 'column'])

source = ColumnDataSource(df)

rows = df['row'].unique()
columns = df['column'].unique()
content = df['content'].unique()

colors = all_palettes['Viridis'][max(len(content), 3)]
mapper = CategoricalColorMapper(palette=colors, factors=content)

TOOLS = "hover,save,pan,box_zoom,reset,wheel_zoom"

p = figure(title="My great heatmap",
           x_range=columns, y_range=rows,
           x_axis_location="above", plot_width=600, plot_height=400,
           tools=TOOLS, toolbar_location='below',
           tooltips=[('cell content', '@content'), ('amount', '@amount')])

p.grid.grid_line_color = None
p.axis.axis_line_color = None
p.axis.major_tick_line_color = None
p.axis.major_label_text_font_size = "5pt"
p.axis.major_label_standoff = 0

p.rect(x="row", y="column", width=1, height=1,
       source=source,
       fill_color=transform('content', mapper))

# color_bar = ColorBar(color_mapper=mapper, major_label_text_font_size="5pt",
#                      location=(0, 0))
# p.add_layout(color_bar, 'right')

show(p)

但是，有两个问题：

1）执行后，我得到一个空的热图：

有什么想法吗？

2）当我超过color_bar = ...部分的color_bar = ... ，我收到一条错误消息：

ValueError：预期为ContinuousColorMapper类型的实例，得到的CategoricalColorMapper（id ='3820'，...）类型为CategoricalColorMapper

我究竟做错了什么？

Answer 1

您的x和y坐标被交换，应为：

p.rect(x="column", y="row", ...)

至于其他消息，它是不言自明的：从Bokeh 1.2开始， ColorBar只能配置有连续的颜色映射器（例如LinearColorMapper ）。 您可以：

• 在Python代码中自己计算颜色，并在source包含一列颜色，或者
• 重新绘制您的绘图以使用LinearColorMapper （ LinearColorMapper content适当地映射到某个数字比例）

Answer 2

对于您的colorBar，解决方案就在这里，我安静地还不了解您的源发生了什么，我将在下一次深入探讨。 colorBar希望您给它一个连续的映射器，并将其分类。

from bokeh.models import (CategoricalColorMapper, LinearColorMapper, 
BasicTicker, PrintfTickFormatter, ColorBar, ColumnDataSource, 
LinearColorMapper)


factors =df['content'].unique().tolist()
colors = all_palettes['Viridis'][max(len(factors), 3)]
mapper = LinearColorMapper(palette=colors)