如何找到重叠的间隔

Question

我有两个data.frame，每个都有六列：样本，染色体，开始，结束，Num_Probes，Segment_Mean。

对于df_T_CNA的每个间隔，我正在寻找df_CF中的哪些间隔重叠。

最后，我打算检查在给定的重叠间隔内，来自df_CF的相应Segment_Mean值是否与来自df_T_CNA的Segment_Mean值相关。 因此，我需要能够将重叠间隔列表的每个间隔与相应的Segment_mean链接起来。

以下是df_T_CNA的前10行：

 Sample Chromosome     Start       End Num_Probes Segment_Mean
 1:   6994          1 120572677 155880744         27    0.5606171
 2:   6994          1 156785697 161284277         33    0.4441370
 3:   6994          1 161293503 161332344          6    0.5120751
 4:   6994          1 162689002 162735917          8    0.6843699
 5:   6994          1 162737215 202304947         32    0.5472524
 6:   6994          1 204394229 204438943         33    0.3533233
 7:   6994          1 204494775 244006533         82    0.4877950
 8:   6994          3  12401692  12402608          3   -0.3402581
 9:   6994          4  55125049  55131282          4    0.3206580
10:   6994          4  55133672  55161497         25    0.4281424

以下是df_CF的前10行：

Sample Chromosome     Start       End Num_Probes Segment_Mean
 1:   6994          1  11166338 214963070         82    -0.007027
 2:   6994          1 226250142 226253672         27    -0.995367
 3:   6994          1 226253673 236701271         33    -0.170850
 4:   6994          2  10931917 232326696         99     0.035982
 5:   6994          3  12634604 183371569        365    -0.107176
 6:   6994          4   1807029 152355557         14     0.029441
 7:   6994          5   1253037 176525002         81     0.060263
 8:   6994          6  26031577 160390678        305    -0.343512
 9:   6994          6 160411955 163984436        266    -0.015047
10:   6994          7   6066171 140494425        878     0.005897

我尝试使用-foverlaps-和-roverlaps-，但是输入格式出现问题。

任何指导将不胜感激。 提前谢谢了。