[英]How do you use ImageJ to measure the columnarity of the cells?
所以,我有一个 .czi 文件,它是一些细胞的图像。 它有几个 z 堆栈。 我想要做的是测量它们的柱状度,即,我希望能够“转换”该图像,这样,我就可以从一侧看它们,而不是从上面看细胞(因此,看看是否他们的柱状与否)。
我已经尝试了 reslice 选项,但是,对于它给我的最终图像,我发现很难看到一个单元格何时结束以及下一个单元格何时开始。
我还有其他选择吗? 或者我可以对重新切片的图像进行任何其他处理以使其更清晰吗?
提前致谢。
选择图像 > 堆栈 > 正交视图(Mac 快捷键是 cmd + shift + H)这将在 XY 视图的右侧和底部显示 YZ 和 XZ 视图。 使用光标将黄色十字准线移动到您要检查的任何单元格。
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