使用 system2 命令的 perl 二进制文件不匹配的问题
[英]Problem with mismatched perl binaries using system2 command
问题描述
我正在尝试从 RStudio 中运行可执行脚本。 该脚本从终端完美运行，但是，当尝试在 R 中运行它时，我收到以下错误消息：
setwd("/users/admin")
command <- "/users/admin/Test_script.command"
system2(command)
> lib/Bio/DB/HTS/Faidx.c: loadable library and perl binaries are mismatched (got handshake key 0xdb00080, needed 0xc500080)
我正在运行 MacOS X Big Sur，我使用 perlbrew 和 perl 版本 5.26.2，我想问题是 RStudio 尝试使用我的系统 ZF83A0AA1F9CA0F7DD5994445BA7D9E80
有任何想法吗？ 谢谢！
1 个解决方案
解决方案1
0 2021-01-19 09:53:30
我通过查看基于 perl 的实际脚本找到了一种让它运行的方法。 然后我能够按照 Michal 的建议按照https://stackoverflow.com/a/65553736/4253357的答案解决问题。 再次感谢你的帮助！
R system 或 system2 命令使用 paste 或 sprintf 运行 bat 文件？
[英]R system or system2 command using paste or sprintf to run bat file?
命令在 powershell 中有效，但不能通过 system()/system2()/shell()？
[英]Command works in powershell but not via system()/system2()/shell()?
如何将stderr和stdout输出附加到system2 R命令中的文件？
[英]How to append stderr and stdout output to file in system2 R command?
在 R 中使用 `system2(..., wait = FALSE)` 运行命令并稍后将其杀死
[英]Run command with `system2(..., wait = FALSE)` in R and kill it later
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