如何使用 FindMarkers function 在 Seurat 中查找簇的标记
[英]How to find clusters' markers in Seurat using FindMarkers function
问题描述
我正在学习 Seurat 进行聚类并找到每个聚类的标记。 我使用 function 找到了集群
FindClusters(scRNA_data, resolution = 5.1)
并获得 20 个簇（Idents(scRNA-seq) 显示级别 0,1,...,19）。 我想为每个集群找到标记基因。 但是，当我尝试
FindMarkers(scRNA_data, ident.1 = 10)
未找到 ident= 10，并且所有 rest 11、12、...、19 都发生了这种情况。请任何人帮忙解决发生了什么？
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