Windows 批处理文件：如何动态获取输入文件名并用作输出文件名？

Question

我正在尝试在 Windows 上创建一个批处理文件来运行这个 psiblast 应用程序。 该命令的示例如下：

psiblast -db swissprot -query ./seq/C3W5S7.FASTA -out ./out/C3W5S7.FASTA

Answer 1

@ECHO OFF
SETLOCAL
rem The following settings for the source directory, destination directory are names
rem that I use for testing and deliberately include names which include spaces to make sure
rem that the process works using such names. These will need to be changed to suit your situation.

SET "sourcedir=u:\your files"
SET "destdir=u:\your results"

FOR %%b IN ("%sourcedir%\*.fasta") DO IF NOT EXIST "%destdir%\%%~nxb" ECHO psiblast -db swissprot -query "%%b" -out "%destdir%\%%~nxb"
GOTO :EOF

请注意，如果您使用固定的绝对源名称和目标名称，则无论当前目录如何，都可以运行此批处理。 如果您将这些名称更改为".\\seq" ".\\out"那么这些目录将相对于您的当前目录。

如果目标文件名已经存在， if not exist语句将不会运行转换。 这显然是可选的。

请注意， psiblast命令仅Echo用于测试目的。 删除该echo关键字以按照列出的方式运行psiblast 。

如果psiblast是一个批处理文件，请将ECHO替换为CALL以执行它。