使用 ImageJ 或 ImageJ 在线查看的 C# 库无法查看图像已尝试 ImageMagick 和 ImageSharp 和 System.Drawing

Question

我有一个可以在 ImageJ 中查看的文件，但大多数软件只是将其显示为黑色。 我正在尝试在 C# 中查看它，但它只是变黑，在油漆中也看不到，但我可以在 INcarta 和 ImageJ 中查看它。 该文件是一个似乎有 LZW 压缩的 16 位 tiff

我正在尝试使用 ImageSharp 解码此图像，然后将其显示为 bitmap。 这是文件https://drive.google.com/file/d/16Xotc-2CJ6HkEJDysfKBkjClkU1OGiyQ/view?usp=sharing的链接

    byte[] data = File.ReadAllBytes(fileToDisplay1);
    
 

            SixLabors.ImageSharp.Formats.Tiff.TiffDecoder decoder = new SixLabors.ImageSharp.Formats.Tiff.TiffDecoder();
            SixLabors.ImageSharp.Formats.Tiff.TiffEncoder encoder = new SixLabors.ImageSharp.Formats.Tiff.TiffEncoder();
            SixLabors.ImageSharp.Image? image = SixLabors.ImageSharp.Image.Load(data, decoder);




            System.Drawing.Bitmap bMap;
            using (var ms = new MemoryStream())
            {
                image.Save(ms, encoder);
                bMap = new Bitmap(ms);
            }

我也试过 ImageMagickQ16

byte[] data = File.ReadAllBytes(fileToDisplay1);
                
                var decoder = new SixLabors.ImageSharp.Formats.Tiff.TiffDecoder();
                var encoder = new SixLabors.ImageSharp.Formats.Tiff.TiffEncoder();
                //encoder.BitsPerPixel = SixLabors.ImageSharp.Formats.Tiff.TiffBitsPerPixel.Bit16;
                var image = SixLabors.ImageSharp.Image.Load(data, decoder);
                MagickImage im2;



               using (var ms = new MemoryStream())
                {
                    image.Save(ms, encoder);
                    im2 = new MagickImage(ms.ToArray());
                }



               //im2.Depth = 16;
                //im2.Grayscale();
                im2.AutoLevel();



               return im2.ToBitmap();

文件看起来像这样：在 ImageJ 中，但是当我上传它或尝试使用其他软件时是黑色的。

我已经评论了我尝试过的其他事情

Answer 1

Imagemagick identify -verbose 认为您的数据是二进制的，只是黑白的。 所以Imagemagick有一些错误。

Image:
  Filename: mystery.tif
  Format: TIFF (Tagged Image File Format)
  Mime type: image/tiff
  Class: DirectClass
  Geometry: 2040x2040+0+0
  Units: PixelsPerInch
  Colorspace: Gray
  Type: Bilevel
  Base type: Grayscale
  Endianness: LSB
  Depth: 16/1-bit
  Channel depth:
    gray: 1-bit
  Channel statistics:
    Pixels: 4161600
    Gray:
      min: 0  (0)
      max: 0 (0)
      mean: 0 (0)
      standard deviation: 0 (0)
      kurtosis: -3
      skewness: 0
      entropy: 0
  Colors: 1
  Histogram:
       4161600: (0,0,0) #000000000000 gray(0)
  Rendering intent: Perceptual
  Gamma: 0.454545
  Chromaticity:
    red primary: (0.64,0.33)
    green primary: (0.3,0.6)
    blue primary: (0.15,0.06)
    white point: (0.3127,0.329)
  Background color: gray(255)
  Border color: gray(223)
  Matte color: gray(189)
  Transparent color: gray(0)
  Interlace: None
  Intensity: Undefined
  Compose: Over
  Page geometry: 2040x2040+0+0
  Dispose: Undefined
  Iterations: 0
  Compression: LZW
  Orientation: TopLeft
  Properties:
    date:create: 2022-09-27T00:43:06+00:00
    date:modify: 2022-09-27T00:42:39+00:00
    date:timestamp: 2022-09-27T00:43:25+00:00
    signature: 28f00fa3c1987b7b8f92961ef3a2d442cca23dbbb7c568b8908cc2fa2271de60
    tiff:alpha: unspecified
    tiff:endian: lsb
    tiff:photometric: min-is-black
  Artifacts:
    filename: mystery.tif
    verbose: true
  Tainted: False
  Filesize: 48240B
  Number pixels: 4161600
  Pixels per second: 84.8629MB
  User time: 0.060u
  Elapsed time: 0:01.049
  Version: ImageMagick 6.9.12-64 Q16 aarch64 17467 https://legacy.imagemagick.org

Mac Preview、GraphicConverter 和 Photoshop 可以读取您的图像，但 16 位范围内的灰度级非常低。 因此，它们乍一看是黑色的。 如果图像动态范围被拉伸，就会出现特征。

但这不适用于 Imagemagick，因为它认为数据是二进制的，因此所有非常低的数据值都已放入黑色 bin。

将错误发布到https://github.com/ImageMagick/ImageMagick/issues的 Imagemagick web 站点

这可能是 Imagemagick 中的错误，或者您的文件根据 tiff 文档格式不正确。 IM 开发人员需要决定使用哪个。

Answer 2

默认情况下，当使用非通用 API 时，TiffDecoder 会将图像解码为Rgba32 （我们可以根据位深度研究 v3 的更新），因此您将不会捕获图像信息，因为您将 16bpp 信息压缩到8个基点。

目前，您可以使用Image.Identify(...)来确定正确的位深度并做出智能解码选择，但是，鉴于您知道该图像是灰度图像并且具有高动态范围，我们只需使用L16 （ 16 位单亮度）对其进行解码component )，然后使用 V3 新添加的方法拉伸直方图。 https://github.com/SixLabors/ImageSharp/pull/2235

using Image<La16> image = Image.Load<La16>(...);
image.Mutate(x => x.HistogramEqualization(new()
{
    LuminanceLevels = 65536,
    Method = HistogramEqualizationMethod.AutoLevel
}));
image.SaveAsPng(...)

结果符合预期。

PM> Install-Package SixLabors.ImageSharp -Version 3.0.0-alpha.0.52 -Source https://www.myget.org/F/sixlabors/api/v3/index.json