R geom_signif 不能 plot 没有明显原因的重要性栏，似乎与 x 比例设置有关

Question

我希望将 geom_signif 用于 plot 我的数据的显着性条，其中包含三个处理级别，test_df 在这里：

治疗	回复
0.1	0.002339829
0.1	0.002542650
0.1	0.001883246
0.15	0.002297212
0.15	0.001722406
0.15	0.002140492
0.15	0.001884400
0.2	0.001606958
0.2	0.002678250
0.2	0.001953940
0.2	0.002167357

这是我使用的代码：

test_df$treatment <- as.factor(test_df$treatment)

ggplot(data= test_df, aes(x=treatment, y=response)) +
  geom_boxplot()+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.15")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.15", "0.2")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.2")), y_position = 0.0041, map_signif_level=TRUE)+
  scale_x_discrete(limits = c("0","0.05","0.1","0.15","0.2"))+ 
  ylim(0, 0.005)

但是，“0.15”、“0.2”之间的意义栏无法显示。 附上 plot： x 刻度设置为“0”、“0.05”、“0.1”、“0.15”、“0.2”

当我尝试在没有自定义 x 刻度的情况下使用 plot 时，最后一个意义栏可以毫无问题地显示。

ggplot(data= test_df, aes(x=treatment, y=response)) +
  geom_boxplot()+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.15")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.15", "0.2")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.2")), y_position = 0.0041, map_signif_level=TRUE)+
  ylim(0, 0.005)

附有 plot：无自定义 x 比例设置

对于我的第三次尝试，我尝试使用更宽的 x 比例范围 plot：

ggplot(data= test_df, aes(x=treatment, y=response)) +
  geom_boxplot()+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.15")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.15", "0.2")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.2")), y_position = 0.0041, map_signif_level=TRUE)+
  scale_x_discrete(limits = c("0","0.05","0.1","0.15","0.2", "0.25"))+ 
  ylim(0, 0.005)

并且“0.15”、“0.2”之间的意义栏无法显示。 附上 plot： x 刻度设置为“0”、“0.05”、“0.1”、“0.15”、“0.2”、“0.25”

当我进一步调整 x 比例时：

ggplot(data= test_df, aes(x=treatment, y=response)) +
  geom_boxplot()+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.15")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.15", "0.2")), map_signif_level=TRUE)+
  geom_signif(comparisons = list(c("0.1", "0.2")), y_position = 0.0041, map_signif_level=TRUE)+
  scale_x_discrete(limits = c("0.05","0.1","0.15","0.2", "0.25"))+ 
  ylim(0, 0.005)

现在显示“0.15”、“0.2”之间的重要性栏。 附上 plot： x 刻度设置为“0.05”、“0.1”、“0.15”、“0.2”、“0.25”

有谁知道为什么会这样？ 我真的更希望将数据绘制在“0”、“0.05”、“0.1”、“0.15”、“0.2”的 x 刻度上。