为什么这个 p.stdin.write 不起作用？

Question

谢谢，因为命令，我能够绕过那一步，但实际问题是这一步。 此步骤的文档中没有给出命令。 [1]我添加了一个菜单选项的示例，例如我想要 select 力场编号 4，因此，当我执行 subprocess.call subprocess.call[path,4]时，它会给我一个错误作为路径文件将被重新调用，菜单选项将消失。 正在使用此调用文件 -

p = subprocess.Popen(path, stdin=subprocess.PIPE, shell = False, universal_newlines=True)

但是当我尝试使用 p.stdin.write 在文件上写入时，它不会写入任何内容。

p.stdin.write("pdb2gmx""-f"+ pname +"-o""processed.gro""-water"+ water_model +"-ff"+ force_field)

pname、water_model、force_field 是全局变量。 当我希望 p.stdin.write 将此命令写入路径文件时，什么也没有发生。

编辑 - 我尝试使用 subprocess.check_call() 而不是 p.stdin.write，但是使用 subprocess.check_call() 每一步都会创建一个新进程并再次调用路径文件，因此先前的进程会被终止并生成一个新进程过程开始。 我不想要那个。

Answer 1

如果pdb2gmx实际上是您要调用的工具的名称，您将需要例如

import subprocess

subprocess.call(
    [
        "pdb2gmx",
        "-f",
        pname,
        "-o",
        "processed.gro",
        "-water",
        water_model,
        "-ff",
        force_field,
    ],
    check=True,
)

而不是启动一个进程并将该命令行写入其标准输入。