write.csv() 和 as.data.frame() 的问题

Question

我正在尝试将矩阵保存到文件中，但出现错误： “Error in command 'as.data.frame.default(A)': cannot convert class 'structure("dsCMatrix", package = "Matrix")' to class "data.frame"”

我知道我不能在write.csv() function 中使用矩阵，但是我在将矩阵转换为数据框时遇到了问题。 谁能给我一些提示

Answer 1

我们可能会在转换为正则矩阵后转换为data.frame

write.csv(as.data.frame.matrix(mat), "file.csv")

Answer 2

您收到错误是因为您试图将稀疏矩阵直接转换为数据框。 您可以将稀疏矩阵转换为完整矩阵，然后使用as.data.frame()将其转换为数据框。 然后您可以使用write.csv()命令将数据框保存到文件中。 但使用as.matrix()时要小心，因为它可能会消耗更多 memory。

object_df <- as.data.frame(as.matrix(object))
write.csv(object_df, "path/to/save/object.csv")