R 更新后在新位置重新安装 R 软件包

Question

我是 R 的新手，但我已经使用了一点。 然而，我遇到了一个问题并且无法弄清楚，尽管已经阅读了十几个其他资源。 由于我不会深入的原因，我不得不更新 R 和 R Studio。 但是，现在我的软件包都不会安装。 例如，当我尝试安装dplyr时，这就是我得到的：

> install.packages("dplyr")

  There is a binary version available but the source version is later:
      binary source needs_compilation
dplyr 1.0.10  1.1.0              TRUE

Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/cancel) Yes
installing the source package ‘dplyr’

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/dplyr_1.1.0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1068347 bytes (1.0 MB)
==================================================
downloaded 1.0 MB

* installing *source* package ‘dplyr’ ...
** package ‘dplyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
/usr/local/Cellar/gcc/9.2.0/bin/g++-7 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG   -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2  -c chop.cpp -o chop.o
/bin/sh: /usr/local/Cellar/gcc/9.2.0/bin/g++-7: No such file or directory
make: *** [chop.o] Error 127
ERROR: compilation failed for package ‘dplyr’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2/Resources/library/dplyr’
* restoring previous ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2/Resources/library/dplyr’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘dplyr’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/private/var/folders/k7/pbrcjpr517x06fhvnkvbq0nc0000gp/T/RtmpAODLeZ/downloaded_packages’
> 

从我在其他类似问题上看到的情况来看，我需要将软件包重新安装到新位置。 但是，假设我是个白痴，我不知道如何在其他地方重新安装它们，在哪里安装它们，或者如何制作现在可以找到我的包的 R/Rstudio。 有人可以帮我解决这个问题吗？

编辑：

我现在知道问题是它找不到 g++-7 字典，但我不知道为什么它试图找到 g++-7，当我的终端说我当前的版本 (12) 是 g++- 12. 为什么 R 不尝试将软件包下载到我的最新版本？

(base) Liams-MacBook-Pro:~ lessig7$ brew list gcc
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/c++-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/cpp-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/g++-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gcc-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gcc-ar-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gcc-nm-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gcc-ranlib-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gcov-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gcov-dump-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gcov-tool-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gfortran
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/gfortran-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/lto-dump-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/x86_64-apple-darwin21-c++-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/x86_64-apple-darwin21-g++-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/x86_64-apple-darwin21-gcc-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/x86_64-apple-darwin21-gcc-ar-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/x86_64-apple-darwin21-gcc-nm-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/x86_64-apple-darwin21-gcc-ranlib-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/x86_64-apple-darwin21-gfortran-12
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/include/c++/ (806 files)
/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/lib/gcc/ (719 files)

一旦我意识到 R 正试图将它保存到旧版本，我试图告诉它使用以下代码保存到新文件夹（只需更改版本号以匹配我终端上的内容）：

install.packages("dplyr", lib="/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/c++-12/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include")

但是，这产生了以下错误：

 install.packages("dplyr", lib="/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/c++-12/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include")
Warning in install.packages :
  'lib = "/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/c++-12/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include"' is not writable
Would you like to use a personal library instead? (yes/No/cancel) 
Error in install.packages : unable to install packages
> 

install.packages("dplyr", lib="/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/bin/c++-12/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include")

我真的很感激任何帮助。 先感谢您。

Answer 1

看来您遇到的问题是由于g++版本缺失所致。

错误消息说：

/usr/local/Cellar/gcc/9.2.0/bin/g++-7: No such file or directory

这意味着安装某些R包所必需的g++编译器不在指定位置/usr/local/Cellar/gcc/9.2.0/bin/g++-7中。

要解决此问题，您可以尝试通过在终端中运行以下命令来安装g++编译器：

brew install gcc

安装g++后，尝试在 R 中再次安装 dplyr R 。 如果问题仍然存在，您可以尝试使用install.packages function 中的 lib 参数将 package 重新安装到其他位置，例如：

install.packages("dplyr", lib="/path/to/new/library")

将"/path/to/new/library"替换为安装包的所需位置。