结构中的指针传递给CUDA

Question

我现在已经搞砸了一段时间，但似乎无法做到这一点。 我正在尝试将包含数组的对象复制到CUDA设备内存中（然后又回来了，但是当我来到它时我会越过那个桥）：

struct MyData {
  float *data;
  int dataLen;
}

void copyToGPU() {
  // Create dummy objects to copy
  int N = 10;
  MyData *h_items = new MyData[N];
  for (int i=0; i<N; i++) {
    h_items[i].dataLen = 100;
    h_items[i].data = new float[100];
  }

  // Copy objects to GPU
  MyData *d_items;
  int memSize = N * sizeof(MyData);
  cudaMalloc((void**)&d_items, memSize);
  cudaMemCpy(d_items, h_items, memSize, cudaMemcpyHostToDevice);

  // Run the kernel
  MyFunc<<<100,100>>>(d_items);
}

__global__
static void MyFunc(MyData *data) {
  int idx = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
  for (int i=0; i<data[idx].dataLen; i++) {
    // Do something with data[idx].data[i]
  }
}

当我调用MyFunc（d_items）时，我可以正常访问数据[idx] .dataLen。 但是，data [idx] .data尚未复制。

我不能在copyToGPU中使用d_items.data作为cudaMalloc / cudaMemCpy操作的目标，因为主机代码不能取消引用设备指针。

该怎么办？

Answer 1

• 为所有结构分配设备数据，作为单个阵列。
• 将连续数据从主机复制到GPU。
• 调整GPU指针

例：

float *d_data;
cudaMalloc((void**)&d_data, N*100*sizeof(float));
for (...) {
    h_items[i].data = i*100 + d_data;
}

Answer 2

您提供的代码仅复制MyData结构： 主机地址和整数。 要过于清楚，您要复制指针而不是数据 - 您必须显式复制数据。

如果数据始终是相同的LENGTH ，那么您可能只想制作一个大数组：

float *d_data;
memSize = N * LENGTH * sizeof(float);
cudaMalloc((void**) &d_data, memSize);

//and a single copy
cudaMemcpy(d_data, h_data, memSize, cudaMemcpyHostToDevice);

如果需要在包含其他数据的结构中，则：

struct MyData {
  float data[LENGTH];
  int other_data;
}

MyData *d_items;
memSize = N * sizeof(MyData);
cudaMalloc((void**) &d_items, memSize);

//and again a single copy
cudaMemcpy(d_data, h_data, memSize, cudaMemcpyHostToDevice);

但是，我假设您拥有各种长度的数据。 一种解决方案是将LENGTH设置为最大长度（并且只是浪费一些空间），然后以与上面相同的方式进行。 这可能是最简单的启动方式，然后您可以稍后进行优化。

如果你负担不起丢失的内存和传输时间，那么对于主机和设备，我将有三个阵列，一个包含所有数据，一个包含偏移，一个包含长度：

//host memory
float *h_data;
int h_offsets[N], h_lengths[N]; //or allocate these dynamically if necessary
int totalLength;

//device memory
float *d_data;
int *d_offsets, *d_lengths;

/* calculate totalLength, allocate h_data, and fill the three arrays */

//allocate device memory
cudaMalloc((void**) &d_data, totalLength * sizeof(float));
cudaMalloc((void**) &d_ffsets, N * sizeof(int));
cudaMalloc((void**) &d_lengths, N * sizeof(int));

//and now three copies
cudaMemcpy(d_data, h_data, totalLength * sizeof(float), cudaMemcpyHostToDevice);
cudaMemcpy(d_offsets, h_offsets, N * sizeof(int); cudaMemcpyHostToDevice);
cudaMemcpy(d_lengths, h_lengths, N * sizeof(int); cudaMemcpyHostToDevice);

现在在线程i您可以找到从d_data[d_offsets[i]]开始的数据，其长度为d_data[d_lengths[i]]