读取R中的数据集，其中逗号用于字段分隔符和小数点

Question

你怎么能在R读取这个数据集，问题是这些数字是浮点数 ，就像4,000000059604644E+16 ，它们用a分隔,

4,000000059604644E-16 ,  7,999997138977056E-16,   9,000002145767216E-16
4,999999403953552E-16 ,  6,99999988079071E-16 ,   0,099999904632568E-16
9,999997615814208E-16 ,  4,30000066757202E-16 ,   3,630000114440918E-16
0,69999933242798E-16  ,  0,099999904632568E-16,  55,657576767799999E-16 
3,999999761581424E-16,   1,9900000095367432E-16,  0,199999809265136E-16

你如何在R中加载这个kinf数据集，所以它有3列。

如果我做

dataset <- read.csv("C:\\data.txt",header=T,row.names=NULL)

它将返回6列而不是3 ...

Answer 1

最好将输入数据转换为在浮点数中使用小数点而不是逗号。 你可以这样做的一种方法是使用sed（看起来你正在使用Windows，所以你可能需要sed使用这种方法）：

sed 's/\([0-9]\),\([0-9]\)/\1.\2/g' data.txt  > data2.txt

文件data2看起来是这样的：

4.000000059604644E-16 ,  7.999997138977056E-16,   9.000002145767216E-16
4.999999403953552E-16 ,  6.99999988079071E-16 ,   0.099999904632568E-16
9.999997615814208E-16 ,  4.30000066757202E-16 ,   3.630000114440918E-16
0.69999933242798E-16  ,  0.099999904632568E-16,  55.657576767799999E-16 
3.999999761581424E-16,   1.9900000095367432E-16,  0.199999809265136E-16

然后在R：

dataset <- read.csv("data2.txt",row.names=NULL)

Answer 2

这是一个使用三个read.table调用的全R解决方案。 第一个read.table语句将每个数据行读取为6个字段; 第二个read.table语句将字段正确地重新组合在一起并读取它们，第三个字段从标题中获取名称。

fn <- "data.txt"

# create a test file

Lines <- "A , B , C
4,000000059604644E-16 ,  7,999997138977056E-16,   9,000002145767216E-16
4,999999403953552E-16 ,  6,99999988079071E-16 ,   0,099999904632568E-16
9,999997615814208E-16 ,  4,30000066757202E-16 ,   3,630000114440918E-16
0,69999933242798E-16  ,  0,099999904632568E-16,  55,657576767799999E-16 
3,999999761581424E-16,   1,9900000095367432E-16,  0,199999809265136E-16"
cat(Lines, "\n", file = fn)

# now read it back in

DF0 <- read.table(fn, skip = 1, sep = ",", colClasses = "character")
DF <- read.table(
   file = textConnection(do.call("sprintf", c("%s.%s %s.%s %s.%s", DF0))), 
   col.names = names(read.csv(fn, nrow = 0))
)

这使：

> DF
             A            B            C
1 4.000000e-16 7.999997e-16 9.000002e-16
2 4.999999e-16 7.000000e-16 9.999990e-18
3 9.999998e-16 4.300001e-16 3.630000e-16
4 6.999993e-17 9.999990e-18 5.565758e-15
5 4.000000e-16 1.990000e-16 1.999998e-17

注意：问题中的read.csv语句意味着有一个标题，但样本数据没有显示。 我假设有一个标题，但如果没有，则删除skip=和col.names= arguments。

Answer 3

它不漂亮，但它应该工作：

x <- matrix(scan("c:/data.txt", what=character(), sep=","), byrow=TRUE, ncol=6)
y <- t(apply(x, 1, function(a) { left <- seq(1, length(a), by=2)
                               as.numeric(paste(a[left], a[left+1], sep="."))
                             } ))