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R中的“加权”回归

[英]“weighted” regression in R

我创建了一个类似下面的脚本来执行我称之为“加权”回归的操作:

library(plyr)

set.seed(100)

temp.df <- data.frame(uid=1:200,
                      bp=sample(x=c(100:200),size=200,replace=TRUE),
                      age=sample(x=c(30:65),size=200,replace=TRUE),
                      weight=sample(c(1:10),size=200,replace=TRUE),
                      stringsAsFactors=FALSE)

temp.df.expand <- ddply(temp.df,
                        c("uid"),
                        function(df) {
                          data.frame(bp=rep(df[,"bp"],df[,"weight"]),
                                     age=rep(df[,"age"],df[,"weight"]),
                                     stringsAsFactors=FALSE)})

temp.df.lm <- lm(bp~age,data=temp.df,weights=weight)
temp.df.expand.lm <- lm(bp~age,data=temp.df.expand)

你可以看到在temp.df ,每一行都有它的权重,我的意思是总共有1178个样本但是对于具有相同bpage行,它们合并为1行并在weight列中表示。

我在lm函数中使用了weight参数,然后我用另一个数据帧交叉检查结果,即temp.df数据帧是“扩展的”。 但我发现2个数据帧的lm输出不同。

我是否误解了lm函数中的weight参数,并且任何人都可以告诉我如何正确运行回归(即不手动扩展数据帧)以获得像temp.df这样的数据集吗? 谢谢。

这里的问题是没有正确地加入自由度以获得正确的Df和均值和平方的统计数据。 这将纠正问题:

temp.df.lm.aov <- anova(temp.df.lm)
temp.df.lm.aov$Df[length(temp.df.lm.aov$Df)] <- 
        sum(temp.df.lm$weights)-   
        sum(temp.df.lm.aov$Df[-length(temp.df.lm.aov$Df)]  ) -1
temp.df.lm.aov$`Mean Sq` <- temp.df.lm.aov$`Sum Sq`/temp.df.lm.aov$Df
temp.df.lm.aov$`F value`[1] <- temp.df.lm.aov$`Mean Sq`[1]/
                                        temp.df.lm.aov$`Mean Sq`[2]
temp.df.lm.aov$`Pr(>F)`[1] <- pf(temp.df.lm.aov$`F value`[1], 1, 
                                      temp.df.lm.aov$Df, lower.tail=FALSE)[2]
temp.df.lm.aov
Analysis of Variance Table

Response: bp
            Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)   
age          1   8741  8740.5  10.628 0.001146 **
Residuals 1176 967146   822.4        

与之比较:

> anova(temp.df.expand.lm)
Analysis of Variance Table

Response: bp
            Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)   
age          1   8741  8740.5  10.628 0.001146 **
Residuals 1176 967146   822.4                    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

我对R-help上没有经常出现这一点感到有些惊讶。 或者我的搜索策略开发能力随着年龄的增长而减弱。

暂无
暂无

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