使用OPENMP进行并行合并排序

Question

我有一个书面的顺序合并排序程序，如下所示：

#include "stdafx.h"
#include "iostream"
#include "omp.h"
#include "fstream"
using namespace std;

int a[50];
void merge(int,int,int); 
void merge_sort(int low,int high)
{
int mid,newval;
double clock, clock1,clock2;
if(low<high)
 {
    mid=(low+high)/2;
    #pragma omp parallel shared(low,mid,high) num_threads(2)
    {
        //newval=omp_get_thread_num();
        //cout<<"thread: "<<newval<<endl;
        merge_sort(low,mid);
        clock=omp_get_wtime();
        //cout<<"Clock: "<<clock<<endl;
        merge_sort(mid+1,high);
        merge(low,mid,high);
        clock1=omp_get_wtime();
        //cout<<"Clock1: "<<clock<<endl;
        clock2=clock1-clock;
        cout<<"Clock2: "<<clock2<<endl;
    }       
    //cout<<"valud=%d"<<low<<endl; 
 }
 }
 void merge(int low,int mid,int high)
 {
 int h,i,j,b[50],k;
 h=low;
 i=low;
 j=mid+1;

 while((h<=mid)&&(j<=high))
 {
    if(a[h]<=a[j])
    {
        b[i]=a[h];
        h++;
    }
    else
    {
        b[i]=a[j];
        j++;
    }
    i++;
 }
 if(h>mid)
 {
    for(k=j;k<=high;k++)
    {
        b[i]=a[k];
        i++;
    }
 }
 else
 {
    for(k=h;k<=mid;k++)
    {
        b[i]=a[k];
        i++;
    }
 }
 for(k=low;k<=high;k++) a[k]=b[k];
    }

    void main()
    {
int num,i;
int clock_n,len;
FILE *fp;
char *buf;
char *newchat;//ifstream properfile;


cout<<"********************************************************************************"<<endl;
cout<<"                             MERGE SORT PROGRAM"<<endl;

cout<<"********************************************************************************"<<endl;
cout<<endl<<endl;
cout<<"Please Enter THE NUMBER OF ELEMENTS you want to sort [THEN PRESS ENTER]:"<<endl;
cout<<endl;
//cout<<"Now, Please Enter the ( "<< num <<" ) numbers (ELEMENTS) [THEN PRESS ENTER]:"<<endl;
//for(i=1;i<=num;i++)
//{
        fp=fopen("E:\\Study\\Semester 2\\Compsci 711- Parallel and distributed computing\\Assignment\\sample_10.txt","rb");
fseek(fp,0,SEEK_END); //go to end
len=ftell(fp); //get position at end (length)
cout<<"Length is %d"<<len<<endl;
//fseek(fp,0,SEEK_SET); //go to beg.
buf=(char *)malloc(len); //malloc buffer
newchat=buf;
fread(newchat,len,1,fp); //read into buffer
fclose(fp);
//cout<<"Read %c"<<newchat<<endl;

////cin>>num;


//}

    merge_sort(1,len);

cout<<endl;
cout<<"So, the sorted list (using MERGE SORT) will be :"<<endl;
cout<<endl<<endl;

for(i=1;i<=num;i++)
cout<<a[i]<<"   ";
cout<<endl<<endl<<endl<<endl;

  }

现在，我想并行化此代码（C中用于并行化的API是OPENMP）。 你能帮助我吗？ 基本上，我使用#pragma parallel num_thread（4），但是我不知道是否应该包括其他任何东西以便进行并行化。

Answer 1

合并排序算法的主要瓶颈是合并功能。 它的复杂度为O（n）。 前几次合并操作的成本将主导整个应用程序的成本。 对大型阵列使用优化的并行算法。

对于较小的阵列（<20个元素），请避开障碍物。 实际上，我更喜欢顺序O（n ^ 2）算法。

您不应该使用节代替#pragma omp parallel shared(low,mid,high) num_threads(2)

Answer 2

如果排序在128位整数32位以下（非常适合CPU缓存），则应该最好执行Binary Insert排序。

如果对较大的数字进行排序，则以下几篇文章将介绍如何进行并行合并排序。

http://www1.chapman.edu/~radenski/research/papers/mergesort-pdpta11.pdf

本文涵盖了OMP和MPI上的split parralel，它没有解释的是如何并行进行合并

http://www.cc.gatech.edu/~ogreen3/_docs/Merge_Path_-_Parallel_Merging_Made_Simple.pdf

本文介绍了如何在parralel中进行合并。 尽管它的名字让我一开始很困惑，但归根结底是，当对两个已经准备好的排序列表进行排序时，等级排序（常规合并方法）要么下降（向上数组A），要么向下交叉（向上数组B）。在所谓的合并路径中合并矩阵。 如果使用多个处理器，则可以通过使用对角线和二进制搜索找到合并路径，来分割区域并在任何点进行等级排序。