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R 中是否有办法在具有 Firth 惩罚可能性的 cox 回归中包含权重?

我正在尝试在 R 中拟合倾向得分加权 cox 回归 model。 但是,其中一个治疗组的事件为零,因此我还需要使用调整方法(Firth 的惩罚可能性)。 我一直在使用coxphf package 来运行未加权模型,但没有一个论点允许在相同的情况下包含权重,因为常规coxph function 允许 ...

2022-08-18 14:43:55 0 14
从 Matchit 中提取 SMD 到 gtsummary

我想从 MatchIt https: //cran.r-project.org/web/packages/MatchIt/vignettes/assessing-balance.html#recommendations-for-balance-assessment 中提取 SMD 值进入 gt 汇 ...

2022-08-15 12:17:08 1 26
使用 pyr2 将 MatchIt 汇总 object 转换为 pandas dataframe

我正在使用 R 的MatchIt package,但通过pyr2 package 从 Python 调用它。 在 R 端 MatchIt 给了我一个复杂的结果 object 包括原始数据和一些额外的统计信息。 其中一个是我想转换为数据集的矩阵,我可以在 R 代码中像这样 我的问题是我不知道如何用 ...

2022-08-04 12:39:40 1 23
R:使用匹配 package 的倾向得分,用于具有特定于子组的变量的数据

我有一个包含大约 20 个变量的数据库,其中四个特定于特定的子组。 对于这四个变量,我已将其他组的数据标记为缺失数据。 我研究的第一步是用遗传算法进行倾向得分匹配。 这个问题的最佳解决方案是什么,知道 matchit package 不允许处理具有缺失值的变量 ...

2022-07-31 18:50:31 0 18
治疗组和对照组

为此,我需要进行准实验并为我的治疗组找到一个对照组。 我想为此使用倾向得分匹配方法。 但是,对于每个数据集,处理发生在不同的年份。 在准备和处理我的数据时如何考虑这个因素? ...

2022-07-28 06:56:33 0 21
如何去除cobalt包中love.plot中的一些类别

我想编辑爱中的变量类别列表。 在我对协变量平衡的评估中绘制。 可以删除图中的某些类别。 我的模型包含许多具有多个级别的分类变量,因此情节非常拥​​挤。 ...

2022-07-17 11:28:14 1 29
R 中的 Matchit - 报告结果

我是倾向得分匹配的新手,并且有一个关于 Matchit 入门小插图的问题。 在报告结果部分指出,“估计效果为 1980 美元(SE = 756.1,p = .009),表明接受治疗的人的平均效果是增加收入。” 但是我在系数的 t 检验中找不到这些值。 我从哪里获得这些值? ...

2022-06-19 21:30:12 0 18
如何在 R 中使用“crrSC”包进行倾向得分匹配队列

我目前正在对一项使用倾向得分匹配的队列研究进行竞争风险分析。 我发现有几篇文章说我应该使用“crrSC”包对分层或聚类数据进行竞争风险分析。 但是,在包的示例中,“crrs”函数要求“strata”。 我不确定如何专门使用这个包进行倾向得分匹配。 任何人都可以帮忙吗? 下面是包中的示例之一。 #u ...

2022-06-11 16:33:26 0 10
psm 平衡诊断的密度图

我正在尝试制作一系列漂亮的密度图,以显示 psm 分析中变量的平衡。 基本的绘图功能会产生一个简单的系列(超过三个以上的绘图)。 钴:bal.plot 产生更好的情节,但我只能弄清楚如何一次做一个。 我可以使用 bal.plot 为所有变量制作一系列或网格图吗? ...

2022-06-06 19:25:41 1 26
使用一些变量创建匹配样本

我的因变量是一个指示变量(1 或 0)。 问题是我的 N 非常大,但是我的因变量 =1 的观察次数非常小(只有 3%),所以当我运行回归时,我的系数非常小。 所以我想在某些维度上创建一个匹配的样本。 我知道我应该使用 psmatch2, 我试过了 但我只有非常少量的“处理过的”和大量的“未处理 ...

2022-05-24 15:04:03 1 78
从协变量平衡倾向得分输出估计稳健标准误差

我正在使用CBPS Balancing Propensity Score (CBPS) 包,我想为包含权重的 ATT 结果估计稳健的标准误差。 MatchIt和twang教程都建议使用survey包将权重合并到稳健标准误差的估计中,并且它似乎有效: 此外, survey SE 与CBPS包提供 ...

2022-05-20 21:16:38 1 33
kmatch:检查倾向得分和匹配的个人

我在Stata中使用kmatch 。 我使用kmatch的原因是除了倾向得分匹配之外,还使用命令ematch来精确匹配特定变量。 这是我的代码: 我认为kmatch与pscore和psmatch2的不同之处在于倾向得分不会自动存储在数据集中。 我想知道是否有办法保存这些倾向得分并检查匹配样本中包含哪 ...

2022-05-13 15:12:27 1 81
使用线性模型进行倾向得分匹配 (R MatchIt)

我想使用从线性模型拟合的倾向得分来匹配使用MatchIt库的观察结果。 例如,假设df是一个数据框。 如果我要使用 logit 的倾向得分来平衡它的treatment列x1 、 x2和x3 ,我会设置distance = 'glm'和link = 'logit' : 如何使用线性模型而不是 l ...

2022-05-10 13:46:37 1 21
为什么 PSM 结果不同使用 R 中的 Matching 和 Matchit

我分别使用 R 包“Matching”和“Matchit”在 R 中进行了倾向得分匹配,但匹配的数量完全不同。 数据集在这里http://web.hku.hk/~bcowling/data/propensity.csv或http://web.hku.hk/~bcowling/examples/pr ...

2022-02-21 18:13:42 1 175
倾向得分匹配后二元匹配结果的优势比和 95% 置信区间

我正在对两种不同的新癌症治疗结果进行倾向评分匹配分析,其中结果是二元的(无癌症或非无癌症)。 成功匹配后,我得到了配对的 2x2 列联表,用于显示匹配对之间的结果,如下所示; 我想通过比较无癌症的优势比来比较结果,以确定一种治疗是否优于另一种治疗。 由于我所做的数据的匹配性质,我被建议进行 McNe ...

2022-02-05 01:07:50 1 23
R 中的 PSM 与特定行

由于 PSM(“Matchit”-Package and Method = full)而获得匹配对,我需要为我的纵向数据框指定我的命令。 每个案例都有几个观察结果,但我只需要将每个患者的第一个观察结果包含在匹配中。 所以匹配应该基于每个患者的第一次观察,但我以后的分析应该包括每个患者的完整数据集和所 ...

2022-01-15 18:58:41 1 21

 
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