awk + 添加基于另一列值的列 + 在 1 命令中添加字段名称
[英]awk + adding a column baed on values of another column + adding a field name in the 1 command
我想在最后添加一个新列，基于另一列的文本（带有 if 语句），然后我想添加一个新的列/字段名称。 我很接近，但我在语法上苦苦挣扎，我正在使用 awk，但很抱歉，自从我使用它以来已经有一段时间了。 我想知道我是否应该使用 python/anaconda(jupyter notebook)，但是使用我目 ...
AWK 遍历列以计算匹配项
[英]AWK looping through columns to count matches
我有一个制表符分隔的文件，如下所示： 样品编号单核苷酸多态性最低限度合子样本1 样品2 样品3 311 rs1490413 一种人 G 一种 G 311 rs730123 G 人一种 G 一种 311 rs7532151 一种人一种 C C 311 rs1434369 G 人吨 ...
使用 $system 来使用 awk 命令
[英]Using $system to use awk command
我有一个输入文件，里面有几个字符（'ABCDABCD'），我试图在 SystemVerilog 中使用awk创建一个输出文件，它是这样写的： 我尝试使用这一行： 但是，我不断收到消息： 期待右括号任何想法为什么以及我应该修复什么？ ...
AWK 列匹配模式
[英]AWK column matching pattern
我正在尝试编写一个命令来查找 csv 文件中与模式匹配的特定列所在的行。 我正在为该列的模式匹配而苦苦挣扎任务：打印第 5 列（col5date）为 2022 年 6 月、7 月或 8 月的行示例 csv 文件： col1 列2 列3 列4 col5date col6 A B C D as ...
使用 AWK 格式化 CSV
[英]CSV Formating with AWK
我有一个脚本，假设运行autorep -j <Job Name> -q并获取上一个命令的输出并将其过滤掉以创建CSV file 。 剧本：#!/bin/bash read -p "Enter /DIR/PATH/FILENAME where you wish to copy ...
使用带有模式列表的 egrep 和 sed 返回单个目标文件中每个模式的第一个实例
[英]Use egrep and sed with pattern list to return first instance of every pattern in a single target file
我在文本文件中有一个冗长的模式列表，每行一个项目。 我使用的是旧版本的 Solaris Unix，因此我必须在命令行中使用 egrep，因为我的脚本编写经验非常有限。 我正在搜索的文件有每个模式的许多实例。 我只想为每个模式返回第一个实例中的行 获取整个匹配列表的命令是 我找到了很多关于如何只返回第 ...
融合第一列的值，当第二列的值在 awk 或 bash 的不同文件中相同时，使用 awk 或 bash
[英]Fuse values from first column, when the values from second column is the same in different files in awk or bash by using awk or bash
我有两个文件，其中包含两列。 在第一列的每个文件中，您都有一个 MGD_number，在第二列中，您有一个 SOL_number。 在 File1 中，你有 MGD226-MGD450 在 File2 中，你有 MGD451-MGD675 我想创建一个新文件，其中基于来自不同文件的相同 SOL_n ...
在匹配行之前访问一行的两个字段
[英]Accessing two fields of a line before a matched line
在文件file.txt中给出以下内容： 我想打印到一个文件： 即，在紧接第一列为Special的行之前的行中，在output1和output2之后存储数字（可以是带小数点的float类型） 我试过： 这捕获了前一行的全部内容，我得到了如下所示的output.txt ： 现在，在捕获的变量f中，如何访 ...
awk 命令：如果行不是以字符开头，则删除行前的新行
[英]awk command: if line doesn't starts with a character remove new line on before line
尝试使用 awk 命令来实现此规则：如果行不以“O|”开头或“一个|” 或“S|” 我想在行前删除新行我在输入中有这个文件（input.txt） 我想要这个输出 执行这段代码awk '/^O\|/ || /^A\|/ || /^S\|/ {printf "%s", $0; next} 1 {prin ...
当列值相同时添加索引
[英]Add index when same column value
我有这两列文件： 第一列有不同的值。 我只想为第二列中的重复值添加索引。 这里chr4出现了两次，所以： 我这样做： 但这甚至为唯一值添加了索引"_1" 。 有什么帮助吗？ ...
处理来自大量输入文件的数据
[英]Processing of the data from a big number of input files
我的 AWK 脚本处理文件夹“${results}”中的每个日志文件，从中查找模式（排名表第一行出现的数字），然后将其与日志文件名一起打印在一行中： 这是每个日志文件的格式，其中的编号 -9.14 应采取 它适用于中等数量的输入日志文件（测试多达 50k 日志），但不适用于大量输入日志（例如 130 ...
BASH 从多个 cvs 文件中提取带条件的数据，对数据进行排序并删除双打。 需要加快进程
[英]BASH extract data with conditions from multiple cvs files, sort data and remove doubles. Need to speed up process
我有一个业余网站，上面有骑自行车的人的赛道。 该站点的一个目标是提供沿 gpx 轨道的 POI（兴趣点）。 我有数百个数据库，每个数据库都有数千个数据。 目前我创建了一个脚本，用于搜索距特定 gpx 点 1 公里范围内的 POI，将结果添加到文件中，对它们进行排序，删除双打。 它有效，但由于我需要为 ...
水平和正确排序数据所需的功能
[英]Function required to sort the data horizontally and properly
我正在尝试对我拥有的数据进行排序，但不幸的是它没有按预期工作。 数据 正如您在上面的数据中看到的，我正在尝试使用以下命令水平打印数据，但数据未按预期打印，因为某些段落包含 3、4、7，我希望它遵循 7 行排序或最高行排序。 以上数据的输出 我正在使用的命令cat test2 | grep -i 'i ...
用 awk 或 sed 替换 fasta 标头中的单个字符
[英]Replace single character in fasta header with awk or sed
我在 bash 中使用 fasta 文件，其标头以“>”开头，以“C”或“+”结尾。 像这样： 我想使用 awk（gsub？）或 sed 将标头的最后一个字符更改为“+”（如果它是“C”）。 基本上我希望所有的序列都以“+”结尾。 没有C。 期望的输出： 序列无需更改。 我认为这很简单，但我正 ...
使用awk根据另一个输入文件更改一个文件的字段值
[英]change field value of one file based on another input file using awk
我有一个具有 10k 行和 4 列的稀疏矩阵（“matrix.csv”）（第一列是“用户”，其余列称为“插槽”并包含 0 或 1），如下所示： 一些包含“0”的槽应更改为包含“1”。 我有另一个文件（“slots2change.csv”）告诉我应该更改哪些插槽，如下所示： 因此，对于 user1，我 ...
下载 RSS 提要并将每个条目保存为单独的 html 文件的 Bash 脚本
[英]Bash script that downloads an RSS feed and saves each entry as a separate html file
我正在尝试创建一个 bash 脚本来下载 RSS 提要并将每个条目保存为单独的 html 文件。 到目前为止，这是我能够创建的内容： 不幸的是，它根本不起作用:(请告诉我我的错误在哪里。 ...
awk 或 sed 根据另一个输入文件更改文件字段
[英]awk or sed change field of file based on another input file
我有一个具有 10k 行和 22 列的稀疏矩阵（“matrix.csv”）（第一列是“用户”，其余列称为“插槽”并包含 0 或 1），如下所示： 一些包含“0”的槽应更改为包含“1”。 我有另一个文件（“slots2change.csv”）告诉我应该更改哪些插槽，如下所示： 因此，对于 user1， ...
仅当包含 2 个特定字符串时才 Grep 行
[英]Grep lines only if containing 2 specific strings
仅当其中包含 2 个特定字符串时才可以grep行吗？ 我有这样的日志，我只想 grep 包含字符串“13/Dec/2022:11”和“GET /fr/test”的行 ...
如何用 awk printf 格式化表格？
[英]How to format table with awk printf?
如何使打印列与格式化表格完美对齐？ 第一个问题是列完全错位，错位的原因是列中单词的长度非常不同。 因此，为了快速修复，我将其通过列进行管道传输，有没有办法使用此设置创建表？ 这是代码的输出 预期产出 ...
反向补充fasta文件中的一些序列
[英]Reverse complement SOME sequences in fasta file
我一直在阅读很多关于反向互补序列的有用帖子，但我收到了一个似乎不寻常的请求。 我在 bash 中工作，我的标准输出中有 fasta 格式的 DNA 序列，我想将其传递给管道。 看似不寻常的一点是，我试图反向补充其中一些序列，以便输出具有相同方向的所有序列（用于稍后的多序列比对）。 我的 fasta ...