igraph 中两个简单图形的多图？

[英]Multigraph from two simple graphs in igraph?

如何从 R igraph 中的两个或多个简单图形中获取多图？ 请注意，两个图在顶点 4 和 5 之间都有一条边，我希望结果是多重图，而不是简单图。 除了 graph.union，还有另一种选择吗？ 谢谢 ...

如何获取清晰图 plot / R-igraph 下缩放 package

[英]How to obtain a clear graph plot / zoom under R- igraph package

假设我们在R下有如下图： 我想要 plot 这张图： Output： 请求：图路径/顶点/边在之前的plot中不明显，我需要更清晰/明显的（如果可能，边具有关联值）。 谢谢 ...

在 R 中定义 ABM 中代理之间的交互可能性

[英]Define interaction possibilities between agents in ABM in R

我在基于 model 的代理中有 100 个代理，我希望他们每个人都有一个大小在 1 到 10 之间的“social.network”。The.networks 定义了他们在模拟阶段可以与谁互动。 为此，我认为我应该构建一个对称矩阵，它定义了谁是其社交网络的一部分。 这基本上可以通过一个约束随机选择 ...

如何将节点列表转换为 igraph 中的边列表？

[英]how to convert a node list to an edge list in igraph?

我有一个空图，需要根据具有内部顶点的凸包绘制该图。 我的尝试是： 右图中的预期结果。 题。 如何将节点列表转换为 igraph 中的边列表？ ...

R package igraph 无法安装，rstanarm 需要。 没有找到 gfortran？

[英]R package igraph cant install, needed for rstanarm. No gfortran found?

Rstanarm 似乎安装正常。 但试图加载： 尝试安装 igraph 时，我收到一段很长的文本，结尾如下： 较旧的答案暗示我需要安装 gfortran，但即使按照此处的说明进行操作： https://masuday.github.io/fortran_tutorial/install_gfor ...

源 ID 和目标 ID 必须是从 0 开始的整数，使用 iGraph 生成网络图时发现类型 [dtype('O'), dtype('O')] 错误

[英]Source and target IDs must be 0-based integers, found types [dtype('O'), dtype('O')] error when generating a network graph using iGraph

我有一个df ，它按降序排列TF和Target .networks 的Importance 。 我现在想使用 iGraph Python 库生成一个图形。 我的代码引发了TypeError: Source and target IDs must be 0-based integers, found ...

在 igraph 中按名称存储节点属性以用于子集图

[英]Storing node attributes by name in igraph for subsetting plots

我正在与一个跨越 5 年数据收集的大型社交网络合作。 我的目的是按月/年对数据进行子集化，以分析各种网络指标的变化。 我想将节点属性存储到数据框中，以便在子集化后可以回调它们。 对于可重现的示例，我想按权重对我的 global.network 进行子集化（例如，边 >2 的所有节点）。 有没有 ...

为一个节点与所有其他节点之间的距离创建一个变量

[英]Creating a variable for the distance between one node and all other nodes

在 R 中使用 igraph package，我将如何创建一个变量来表示一个特定节点与所有其他节点之间的距离？ 这是我到目前为止所拥有的。 数据由一个表组成，其中第一列 (employee-name) 包含所有公司员工的姓名。 第二列（主管）包含每个员工的直接主管的姓名。 我试图找到公司董事（下面代 ...

R中带ggplot的圆图

[英]Circular graph diagram with ggplot in R

我正在写一个建议。 我想在我用ggplot或其他一些 R package 附加的图像中生成图形。我尝试使用ggplot和igraph但它没有用。 我有一个带有许多零的邻接矩阵，其中连接值 go 从 -1 到 1。该矩阵具有行和列标签。 它是一个无向图。 我使用igraph package 将矩阵转换 ...

Python igraph 中的最短路径不正确？

[英]Incorrect shortest path in Python igraph?

当我为节点 11 运行它时（你可以输入它），它会生成一条通过节点 0、1、4、11 的最短路径 90。 但是，通过长度为 85 的节点 0、2、6、4、11 有一条 85 的较短路径。 igraph function 中似乎有错误，有人可以确认或提出其他建议吗？ 干杯，保罗我认为 igraph ...

将数据框变成边缘列表

[英]Turning a data frame into an edgelist

假设我有以下数据框 我想要的是最终得到一个看起来像这样的数据框...... 我怎样才能做到这一点？ 如果可能，最好使用 tidyverse。 ...

在 Python 中查找连通球体路径的高效方法

[英]Time-efficient way to find connected spheres paths in Python

我在Python中使用NetworkX库编写了一段代码来查找连接的球体路径。 为此，我需要在使用图形之前找到球体之间的距离。 这部分代码（计算部分（ numba函数）--> 查找距离和连接）导致 memory 在numba并行方案中使用 arrays 时出现泄漏（我在使用np.linalg或s ...

igraph：终端（非根）节点处于同一级别的树形图？

[英]igraph: tree graph where terminal (not root) nodes are at same level?

我想 plot 在 R 中创建一个带有igraph的树形图，所有终端节点都在同一级别，这与默认情况下所有根节点都在同一级别不同。 layout_as_tree有办法做到这一点，基于根节点。 需要指定它们（ root ）以及它们的级别（ rootlevel ）。 所以我可以使用这个选项，虽然它似乎 ...

用不同的 colors 绘制“标记组”

[英]Plotting “mark groups” with different colors

我对 igraph 很陌生，并且一直在策划我的一个项目。 在我的 python 代码中，我使用了： 来识别组。 问题是这个 VertexCluster 的着色。 当使用 VertexCluster 作为视觉样式的“mark_groups”时，组是灰色的。 尽管使用了“mark_col”，但它并没有 ...

我可以在 Python igraph 中有一些弯曲的边缘和其他直的边缘吗？

[英]Can I have some edges curved and other straight in Python igraph?

我正在尝试创建 Python igraph 中所示的图形，但我无法显示一些直线边缘和弯曲边缘。 这可能吗，edge_curved function 似乎只接受一个参数。 ...

在没有 map 的 Tidygraph 中节点附近的变异函数

[英]Mutate functions on the neighborhood of a node in Tidygraph without a map

我有一个带有属性W的图表。 我想mutate邻居的平均W 我想让代码尽可能简单，尽量避免使用maps和其他显式函数进行矢量化，因为这是出于教学目的。 我的代码试图很好地展示每个段落，如下所示： 有没有办法执行这些操作而不会重复到map ？ Tidygraph 有一个类似的包装器，它是local_a ...

根据下游值为 R igraph 中的所有上游节点分配值

[英]Assign value to all upstream nodes in R igraph based on downstream value

当谈到网络图时，我已经超出了我的深度，但我有一个 ~6300 From/To 链接的表，类似于下面给出的数据框df 。 每个顶点都有一个称为status的二进制属性。 我想做的是确定status = 1的顶点上游的所有顶点，我将如何在igraph中执行此操作？ 我看过data.tree但我的数据不一 ...

如何找到“直接”连接的组件？

[英]How to find a "direct" connected components?

我不懂图论，所以恐怕问题的标题不是属性公式，所以我将显示一个代码： 有了上面的data.frame ，我知道如何找到所有连接的组件，无论它们“如何”连接。 但我也希望能够找到上面代码块末尾显示的东西，即“6”不属于“1”组，但与“3”相连，这就是为什么我有重复“3” - 它属于“1”和“2”组。 ...

igraph - 具有定义权重的边缘的最短路径

[英]igraph - shortest path from edges with defined weights

我目前正在尝试在一个非常大的加权图中（160K 节点，1500 万条边）计算每对连接节点之间的最短路径。 我想找到每两个节点之间最短路径中的边数，当所有权重> =两个节点之间的边权重的边都被删除时。 如果找不到路径，我会取最短路径为1（即连接节点的已删除边）。 是否可以使用igraph v0. ...

Plot 来自多个邻接矩阵的树

[英]Plot a tree from multiple adjacency matrices

我正在尝试 plot 来自多个邻接矩阵的树。 为了更好地解释，我将用 3 个矩阵做一个例子。 我有 3 个矩阵a ， b和c 。 a 的行指向a的列。 a的列与b的行同名，指向b的列，依此类推，使用c矩阵。 因此， a行是树的第一级， b行（ a列）是第二级， c行（ b列）是第三级。 这些是邻 ...