"`igraph`包中`closeness`定义的`mode`字段中的`total`是什么意思？"

[英]What does `total` mean in the field `mode` of `closeness` definition in `igraph` package?

igraph包中closeness定义的字段mode中的total是什么意思？ ...

如何在 Python 中使用 Igraph package 仅使用更大的社区 plot？

[英]How to plot only bigger communities with Igraph package in Python?

我是网络世界的新手，我需要 python package Igraph 方面的帮助。 我创建了我的网络，并为集群应用了 community_walktrap()。 现在，我想 plot 只是具有超过 10 个元素的集群。 你知道我该怎么做吗？ 对于 plot 一切，我正在使用： 但我不知道是否有办 ...

如何在 R 中的几个模拟图上应用 function

[英]how to apply a function on several simulated graphs in R

我需要在几个模拟图（例如分类）上的 function 的几个结果的向量（或列表）。 这是为了模拟蒙特卡洛程序，使用随机块模型而不是 Erdos-Renyi 模型执行分离分析。 由于数据收集的设计，这允许区分两种类型的参与者之间链接的概率，方法类似于条件统一图。 我尝试使用以下循环失败： 我也尝试过 ...

`igraph` 如何使用 Dijkstra 算法计算加权有向网络中的最短路径？

[英]How does ` igraph` calculate the shortest path in a weighted directed network, using Dijkstra's Algorithm?

我想计算网络的介数，例如 我想使用 package: betweenness(g)提供的命令。 但我不知道igraph中两个节点之间的距离是如何计算的。 是重量的总和吗？ 还是权重的倒数之和？ ...

随机网络 plot 设置在 R

[英]Random network plot setting in R

我使用 620 个节点和 2102 个边生成了一个随机网络。 我想通过使用 plot 来可视化它。但是，1. 不知道如何使 plot 更好（至少使节点更加分离）？ 2.根据“度”调整节点大小。 我的代码是： 我目前的 plot 如下： ...

如何保存 igraph object

[英]How to save an igraph object

我在将数据框写入 csv 文件时遇到问题。 g 看起来像这样 以下代码均无效 它显示了这个错误 如何将 g 或 members(cluster_edge_betweenness(g)) 写入 a.csv 文件？ 提前感谢您的帮助。 ...

使用 Dijkstra 算法的最短路径（在 R 中，来自数据帧）

[英]Shortest Path with Dijkstra’s Algorithm (in R, from a dataframe)

我正在尝试使用 Dijkstra 算法找到图形节点之间的最短路径，方法是使用以下文章中包含的代码： https://www.r-bloggers.com/2020/10/finding-the-shortest-path-with-dijkstras-algorithm/ 但是此代码从边缘列表创 ...

如何创建具有固定度数序列的随机二部图？

[英]How do I create a random bipartite graph with fixed degree sequence?

我想在 igraph 或其他 r package 中生成具有固定度数序列的随机二分图。 我熟悉如何生成具有固定度数序列的随机图以及如何在 igraph 中生成随机二部图 - 但我无法理清如何生成具有固定度数序列的随机二部图（如 Newman，Watts 所述和 Strogatz (2002))。 ...

匹配 2 个图中的边

[英]Matching edges in 2 graphs

我有 2 个图表，我们称它们为 g1 和 g2。 图 g2 与 g1 具有相同的结构，但包含 g1 中不存在的新边。 我必须找到这些边缘。 在这种情况下，我正在寻找的是边缘 3--5。 到目前为止，我想使用 g1 的补码，然后将其与 g2 的边匹配以找到这些新边。 问题是我在语法上有问题。 （R ...

从成对比较构建集合

[英]Building sets from pairwise comparisons

试图概括地阐述我的问题：我对多个元素进行了成对比较，并希望从这个邻接矩阵构建集合（组）（即构建成对比较等于TRUE的元素的组）。 例如：我有 6 个形状。 形状 1 与形状 2 重叠，形状 2 与形状 3 重叠。形状 4 是单独的，形状 5 与形状 6 重叠（见下文） 如果我在所有形状之间进行成对 ...

如何修改此图的布局？

[英]How to modify the layout of this graph?

我创建了一个图形 object，但我想自己选择布局。 我想到的布局是这样的，第一个节点F s 放在最左边，然后是DC s，然后是CC ，最后是W s 在最右边。 我们也可以将DC和CC并排放置。 您可以通过以下代码生成图形： 我尝试了plot function 中的layout参数，但结果不是我想 ...

根据组和时间段从 dataframe 创建边缘列表

[英]Create edgelist from dataframe depending on groups and time period

我正在尝试从取决于两件事的数据框创建边缘列表：（1）在同一时间段内属于同一组（2）。 一个人可能同时属于多个组。 这是我到目前为止得到的： 但是，我不知道如何将其划分为多个年份，例如：当 persX 和 persY 同时属于同一组时，两个人之间应该只有优势。 我假设数据需要放入长格式，所以我尝试使用 ...

尝试使用 python-igraph 绘制 plot 图形时不存在关键错误属性

[英]key error attribute does not exist when trying to plot graph with python-igraph

我正在尝试遵循本教程： https://towardsdatascience.com/newbies-guide-to-python-igraph-4e51689c35b4 我跟着它写了这封信（实际上是复制和粘贴），但我不断收到以下错误： KeyError: 'Attribute does not ...

Igraph中不一致的局部传递性Output

[英]Inconsistent Local Transitivity Output in Igraph

我需要确定网络中每个节点的传递性，但得到的结果不一致。 这提供了 output： 但是当我尝试指定单个节点时，output 中的某些值不匹配： 事实上，当我尝试计算所有顶点的局部传递性时，许多与我将 vids 参数排除在外的情况不同。 在某些情况下，当我尝试过这个时，一切都不同了。 如果我将 vi ...

使用 igraph 查找特征向量中心性的并列排名

[英]Finding tied rankings of eigenvector centralities using igraph

我不确定为什么下面的代码会为没有平局指令的命令和使用平均平局等级方法的命令产生相同的等级。 我正在使用 igraph 来获取图的特征向量中心性，负排名以使排名 go 从最大到最小。 似乎并列排名线的 output 应该是：2,2,2,4.5,4.5 ...

有效地为每个节点 igraph 提取权重最大的边

[英]Efficiently extract edges with biggest weight for each node igraph

我有一个加权无向简单图。 节点数约为数万，边数也是如此（这是一个稀疏图/矩阵）。 对于每个节点，我想找到最大边权重（“最大分数”）并将其与共享该边的节点一起存储在数据框中。 数据框将包含三列： node_name - str, max_score - float [0-1], max_score_n ...

R - 如何修改图例？

[英]R - How to modify the legend?

我想通过调整列数（例如从一列九行到三列三行）来修改我的 plot 中的图例（见下文）。 我已经尝试添加guides(alpha = guide_legend(ncol = 3))来调整列数。 但是，这不起作用（我认为“alpha”不是正确的论点，但我找不到合适的论点）。 示例代码和 plot： ...

如何使用 igraph 确定 R 中每个簇的顶点数

[英]How to determine number of vertices per cluster in R with igraph

通常，当我想确定图的顶点数时，我只需要在我的脚本中编写： 然后我就有了。 问题是我正在尝试确定每个集群（社区）的顶点数，但我不知道该怎么做。 igraph 中是否有任何 function 可以帮助我做到这一点？ 到目前为止，这是我的代码： igraph 中是否有任何 function 可以帮助我 ...

R - 找到邻居的邻居并将它们存储在唯一的邻接矩阵中

[英]R - finding the neighbors of neighbors and storing them in a unique adjacency matrix

A是存储为矩阵 object 的邻接矩阵： A的图形如下所示： 我正在尝试识别邻居的邻居，并创建一个新的邻接矩阵N ，其值可以捕获距离给定节点i仅一步之遥的某个节点j的邻居。 例如，在A中， 3是1 1 4和8的邻居。 但是3是既不是4也不是8的邻居。 在所需的邻接矩阵N中，我希望表示3的行/ ...

igraph 中的特征向量中心性是否错误？

[英]Is eigenvector centrality in igraph wrong?

我正在努力提高我对特征向量中心性的理解。 华盛顿大学的这篇概述非常有帮助，尤其是与此 R 代码一起阅读时。 但是，当我使用evcent(graph_from_adjacency_matrix(A))时，结果会有所不同。 下面的代码 秩相关是相同的，但值不一样仍然很麻烦。 到底是怎么回事？ ...