如何 plot 只是 ggplot2 中的传说？

[英]How to plot just the legends in ggplot2?

我目前正在使用 igraph 并用颜色标记我的顶点。 我想添加一个说明每种颜色代表什么的图例。 此时我能想到的是使用 ggplot2 仅打印图例并隐藏条形 plot。 有没有办法只是 output 传说？ ...

igraph中社区检测算法之间有什么区别？

[英]What are the differences between community detection algorithms in igraph?

我有一个大约100个igraph对象的列表，其中一个典型的对象有大约700个顶点和3500个边。 我想确定哪些关系更有可能的顶点组。 我的计划是使用混合模型来预测使用顶点和组属性有多少组内关系顶点。 有些人可能想要回应我的项目的其他方面，这将是伟大的，但我最感兴趣的是有关igrap ...

如何从边缘列表创建加权邻接列表/矩阵？

[英]How to create weighted adjacency list/matrix from edge list?

我的问题很简单：我需要从边列表中创建一个邻接列表/矩阵。 我有一个存储在 csv 文档中的边列表，其中 column1 = node1 和 column2 = node2，我想将其转换为加权邻接列表或加权邻接矩阵。 更准确地说，数据如下所示 - 其中数字只是节点 ID： 关于如何实现从这个到 ...

igraph创建加权邻接矩阵

[英]igraph creating a weighted adjacency matrix

我正在尝试使用igraph包来绘制（稀疏）加权图。 我目前有一个邻接矩阵，但无法获得graph.adjacency函数来识别边权重。 考虑以下随机对称矩阵： 为了绘图，首先我必须将这个邻接矩阵变成正确的igraph格式。 使用graph.adjacency这应该相对简单。 根 ...

如何使用固定位置控制 igraph plot 布局？

[英]How to control the igraph plot layout with Fixed Positions?

我正在尝试绘制一个类似于流程图的网络可视化。 我与以下代码相当接近，但我有几个问题： 这是最好的 layout() 算法，还是我可以为每个节点手动分配一个 position> 如何确保这些节点不会在 plot 中重叠（就像他们在这里所做的那样）？ 我可以将一个节点指定为“锚点”或起点吗？ 即 ...

我应该使用哪种布局来获得igraph中不重叠的边？

[英]Which layout should I use to get non-overlapping edges in igraph?

我正在尝试使用树状数据构建图形，其中节点通常分成> 2个边缘。 我尝试了各种布局，我看到layout.reingold.tilford参数将生成具有非分叉数据的树状图。 然而，产出并不是特别有吸引力。 我宁愿使用类似layout.lgl或layout.kamada.kawai的东西， ...

在R igraph中正确地着色顶点

[英]Correctly color vertices in R igraph

我正在使用igraph来着色顶点 我有两个CSV文件答案和图表拓扑。 答案:(这告诉玩家K和N正确回答） 拓扑:(代表谁与谁联系） 我想使用包IGraph构建一个图形，并根据它们的正确性为不同颜色的顶点着色。 这就是我能够实现的目标： 问题是在我的输出中 ...

增加 igraph 节点之间的距离

[英]increasing the distance between igraph nodes

我有一个使用 igraph 生成的图表。 我想分散节点。 到目前为止，我找到的唯一方法是缩放布局并强制绘图命令不重新缩放。 如果我不重新缩放，中央高度连接的节点会聚集在一起，我会得到一个这样的图表，其中图表主体中的模式无法辨别： 另一方面，如果我告诉 plot 命令不要重新缩放，那么我会得到 ...

python + igraph“绘图不可用”

[英]python + igraph “plotting not available”

我在 RHEL 机器上从源代码安装了 python-igraph 0.5.4 和 igraph 0.5.4（也测试了 0.6）。 一切都很好，除非我试图绘制我得到的图。 “类型错误：绘图不可用” 在配置或安装阶段没有错误或警告。 我需要在 linux 上安装什么才能使绘图工作？ 我没有roo ...

Networkx中的社区检测

[英]Community detection in Networkx

我正在研究网络中的检测社区。 我用的是igraph和Python 对于模块化度量方面的最佳社区数量： 为供应所需数量的社区： 但是，我喜欢使用networkx这样做。 我知道在模块化度量方面获得最佳社区数量： 但我无法获得所需数量的社区。 使用Networ ...

pycairo“ImportError：DLL加载失败：无法找到指定的模块。”即使安装了DLL

[英]pycairo “ImportError: DLL load failed: The specified module could not be found.” even after DLLs installed

我在这里遵循pycairo安装说明： http ： //www.cs.rhul.ac.uk/home/tamas/development/igraph/tutorial/install.html安装pycairo以便与igraph一起使用。 但是，即使在运行安装程序并根据说明将所有DLL解 ...

在R中使用graph.adjacency（）

[英]using graph.adjacency() in R

我在R中有一个示例代码如下： 我使用csv文件作为输入，其中包含以下数据： 在此之后，我使用以下命令检查重量值： 预期输出有点像这样： 但我得到了奇怪的价值（每次都不一样）： 我无法找到我做错的地方和地点？ 请帮助我得到正确的预期结果，也请告诉我为什么这 ...

使用矩阵调整igraph中的节点大小

[英]Adjusting the node size in igraph using a matrix

我有以下网络图： 并希望使用如下矩阵调整节点的大小： 我是怎么走的？ ...

iGraph图中的顶点名称在哪里

[英]Where are the vertex names in an iGraph graph

我的一般问题是，当使用iGraph生成图形时，我松开了顶点名称/标签（这里不确定正确的单词）。 我有一个二分网络的边缘列表IC_edge_sub，如下所示： 然后我创建一个图元素： 然后折叠它以仅识别companyID之间的连接 然后得到邻接矩阵： 在iGr ...

根据边缘属性更改igraph图R中的边缘厚度

[英]Change edge thickness in igraph plot R according to Edge Attributes

我想更改图表的边缘宽度以对应edge.betweenness得分。 我还尝试将边缘间度分数创建为边缘权重，并将其分配给绘图函数中的edge.width参数，如下所示; ...

在NetworkX中通过边缘和节点属性查询图表的最佳实践

[英]Best practices for Querying graphs by edge and node attributes in NetworkX

使用NetworkX和新的库，进行社交网络分析查询。 通过查询，我的意思是按边缘节点的属性选择/创建子图，其中边创建路径，节点包含属性。 该图表使用的是表格的MultiDiGraph 查询 有更好的查询方式吗？ 或者，最好的做法是创建自定义迭代来创建子图？ 或者（和一 ...

igraph库出错 - 不推荐使用库

[英]Error with igraph library - deprecated library

我已经将我的计算机改为Linux Mint x64操作系统，当我尝试执行和我制作的旧程序时，我有一个python库，igraph库的麻烦。 弃用警告：为避免与igraph项目发生名称冲突，此可视化库已重命名为“jgraph”。 请在方便时升级。 我找不到有关如何更改新库代码的 ...

如何使用igraph包从数据框构建图形？

[英]How do you build a graph from a data frame using the igraph package?

有什么方法可以从R中的数据帧构建图形（igraph程序包）？ 数据帧包含节点关系。 边缘是： ...

安装python-igraph失败

[英]Failing to install python-igraph

我正在尝试安装 python-igraph。 运行sudo pip install python-igraph我得到以下日志： 如果我用sudo python setup.py install来做，我也会遇到类似的情况。 显然问题出在C核心上。 如何安装它的正确版本以便我可以安装 igrap ...

来自 numpy 或 pandas 邻接矩阵的 igraph 图

[英]igraph Graph from numpy or pandas adjacency matrix

我有一个存储为pandas.DataFrame的邻接矩阵： 我想从pandas或numpy邻接矩阵创建一个igraph.Graph 。 在理想的世界中，节点将按预期命名。 这可能吗？ 该教程似乎对这个问题保持沉默。 ...