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在R中生成热图（无法分配矢量警告）

[英]generate heatmap in R ( cannot allocate vector warning)

原文 2015-08-29 14:49:00 8 1 r/ heatmap/ regular-language

so I'm trying to generate a heatmap in R for gene expression analysis... I have 536 GB of memory in C, however when I tried to do a heatmap, it shows this message. 因此，我试图在R中生成一个热图以进行基因表达分析...我在C中有536 GB的内存，但是当我尝试做一个热图时，它会显示此消息。

Error: cannot allocate vector of size 11.1 Gb In addition: Warning messages: 1: In distfun(x) : Reached total allocation of 3544Mb: see help(memory.size) 错误：无法分配大小为11.1 Gb的向量另外：警告消息：1：在distfun（x）中：已达到3544Mb的总分配：请参阅help（memory.size）

how can i solve this, anyone? 谁能解决这个问题？ im running R in Windows OS, 64bit 我在Windows OS 64位环境中运行R

1 个解决方案

我知道R有一个内存限制，如这里所示，但是看起来您可以使用memory.limit（）覆盖它。

优化帮助（R无法分配向量） - Optimization help (R cannot allocate vector)

R合并帮助-无法分配大小为215.2 Mb的向量 - R Merging Help - cannot allocate vector of size 215.2 Mb

合并数据帧时R无法分配向量 - R cannot allocate vector when merging data frames

R + ggplot2 - 无法分配大小为 128.0 Mb 的向量 - R + ggplot2 - Cannot allocate vector of size 128.0 Mb

错误：无法在 R 中分配大小为 X Mb 的向量 - Error: cannot allocate vector of size X Mb in R

具有R.的随机森林无法分配大小为7.5 Gb的向量 - Random Forest with R. cannot allocate vector of size 7.5 Gb

错误：无法分配大小为1000.0 Mb R的向量 - Error: cannot allocate vector of size 1000.0 Mb R

Memory R 中的问题“错误：无法分配大小为 344 kb 的向量” - Memory problem in R “Error:cannot allocate vector of size 344 kb”

栅格数据：memory R 问题 - 无法分配矢量 - raster data: memory issue with R - cannot allocate vector

R lm函数错误：无法分配大小为8.4 Mb的向量 - R lm function Error: cannot allocate vector of size 8.4 Mb

暂无

暂无

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