无法升级 gcc/g++ 版本？
[英]Cannot upgrade gcc/g++ version?
问题描述
When I tried to install bedtools in ubuntu 18, it showed the error as below:
当我尝试在 ubuntu 18 中安装 bedtools 时，它显示错误如下：
cc1plus: error: unrecognized command line option "-std=c++11" make[1]: * [../../../obj//FileRecordMgr.o] Error 1
I guess the problem comes from gcc/g++ version.我猜这个问题来自 gcc/g++ 版本。 Currently, gcc version is 4.4.7.目前，gcc 版本为 4.4.7。 However, I cannot upgrade gcc/g++ using sudo command because I am installing it on HPC cluster.但是，我无法使用sudo命令升级 gcc/g++，因为我将它安装在 HPC 集群上。 Could you suggest me some alternative ways to solve this problem?你能建议我一些替代方法来解决这个问题吗？
1 个解决方案
解决方案1
0 2019-10-10 07:32:46
... tried to install bedtools in ubuntu 18... unrecognized command line option "-std=c++11".
Ubuntu 18.04.2: The default gcc / g++ is version 7.4.0. Ubuntu 18.04.2：默认 gcc / g++ 是版本 7.4.0。 Quite unusual that it is set to 4.4.7.很不寻常的是它被设置为 4.4.7。 If you cannot change to g++-7.4, a "bedtools2-bin package" can be used.如果不能改成g++-7.4，可以使用“bedtools2-bin包”。
$ git clone https://github.com/arq5x/bedtools2.git
$ cd bedtools2/
$ make
### the folder bin/{bedtools + 38 scripts} is created
Package: bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz https://drive.google.com/drive/folders/1OjAsgpzqx-sK_3PF8FUGuinYqW_jVEWg?usp=sharing Package：bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz https://drive.google.com/drive/folders/1OjAsgpzqx-sK_3PF8FU=GuinYqWgus?
Unpack bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz:解压bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz：
$ cd bedtools2/
$ tar xvf bedtools2-bin_2.29.0-ubuntu18_amd64.tar.gz
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