变量重要性 plot 在 R 中使用随机森林 package

Question

I created a random forest model and now want to look at the variable importance.我创建了一个random forest model现在想看看变量的重要性。 While trying to do so, it only shows the MeanDecreaseGini plot, not the MeanDecreaseAccuracy plot. If I try to specify type = 1 , it gives an error saying在尝试这样做时，它只显示MeanDecreaseGini plot，而不是MeanDecreaseAccuracy plot。如果我尝试指定type = 1 ，它会给出错误提示

Error in imp[, i]: subscript out of bounds imp[, i] 错误：下标越界

but the same doesn't happen with type = 2 .但是type = 2不会发生同样的情况。

The code I used is:我使用的代码是：

RF_Model<- randomForest(as.factor(Ash )~B1+B2+B3+B4+B5+B6+B7+B8+B9+B10+B11+B12+B13+B14+B15
                        +B16+B17+B18+B19+B20, data=Subset, ntree=2000, Importance=TRUE)
print(RF_Model)
Important=RF_Model$importance
View( Important).

Could anyone help me with this?谁能帮我解决这个问题？

Answer 1

It should be importance=TRUE instead of Importance=TRUE .它应该是importance=TRUE而不是Importance=TRUE 。 Please, see below for reproducible example:请参阅下面的可重现示例：

rf = randomForest(Species ~ .,data=iris,Importance=TRUE)
importance(rf,type=1)

Sepal.Length
Sepal.Width 
Petal.Length
Petal.Width 

rf = randomForest(Species ~ .,data=iris,importance=TRUE)
importance(rf,type=1)
             MeanDecreaseAccuracy
Sepal.Length            10.035280
Sepal.Width              4.849584
Petal.Length            32.512948
Petal.Width             34.386394

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2 已采纳 2020-02-23 21:18:42

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