赏金将在 7 天后到期。 此问题的答案有资格获得+50声望赏金。 stats_noob正在寻找来自信誉良好的来源的答案: 你好? 有人可以告诉我如何使用 R 中的 vi.network 执行此操作吗? 谢谢! 我正在使用 R 编程语言。 我有以下数据集: 我根据这些数据制作了以下 graph.n ...
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赏金将在 6 天后到期。 此问题的答案有资格获得+100声望赏金。 stats_noob正在寻找来自信誉良好的来源的答案: 您好,我有兴趣了解可以尝试在 R 中解决此问题的不同方法。最后:最终的 output 应该是一个(独立的)HTML 文件,可以离线查看。 注意:我不是在寻找 Rshiny ...
我目前正在研究几个图来生成它们的边缘介数和节点紧密度,使用 python-igraph,设置为未定向、加权和截止。 可以成功获取边介数。 但是对于closeness,只有在没有设置cut-off的情况下才能返回结果; 或者 output 只能是 1 或 NaN。 无论图表的大小和权重如何,都会发生 ...
我在 igraph 中制作了 2 个 distinct.network 并想将它们合并到一个图中。 每个单独图的每条边都需要出现在组合图中,但缺少多条边。 如何让每条边出现在合并图中? 一个可重现的例子 这些图表的结果如下: 问题脱节图:顶图:顶点 C 有 6 个入边; 1 条出边 下图:顶点 ...
我正在使用 igraph fit_power_law package 中的 fit_power_law function。function 返回“KS.p”(Kolmogorov-Smirnov 检验的 p 值)作为适合度的显着性检验。 据我了解,KS p 值越小,就越有可能拒绝数据来自幂律分布的假 ...
这是在我有 colors 来自我想要的模块 label 的地方解决的问题。现在我想知道如果我有另一个节点文件我该如何放置注释我想要我的图表像这样或类似的东西 他们根据基因的功能富集对网络进行了注释这是我生成基本图我的文件的基本代码 Plot 数据 V(g) # 节点 V(g)$name # 每个节 ...
我有简单的 dataframe,这是我在运行 WGCNA 后获得的,其中相关性已变成 object 的边列表,我给出了一个小子集 我的 dataframe 看起来像这样 在我上面的一小部分数据中,我有两个模块组合,可以在module1列上看到,这是我的源列和moduel2我的目标列颜色以及前两列中的 ...
对于带有 igraph 的 a.networkanalysis,我想从一个表中创建一个边缘列表,该表具有包含在 Origin 变量中的边缘属性。 我导入了一个 excel 文件,看起来像这样 之后我将第二列分成多列并修剪空格。 这是我的数据集的一部分。 我已经通过将数据框转换为矩阵并使用 cbind ...
我使用 igraph 绘制了一个二分图。 我想用不同的 colors 为我感兴趣的特定节点着色。 我使用的代码是 bmat=as.matrix(read.csv(file = "/home/tejaswini/Desktop/Butterflyplantdata.csv", sep = "\t", ...
我想计算 a.network 中节点的集线器分数。 我在 R 和 function“hub_score”中使用 igraph。 在这个 function 中是参数“scale”,它可以设置为 TRUE 或 FALSE。 如果我将其设置为 TRUE,.network 中最高的 hub 分数是否始终为 ...
我有这样的矩阵来构建有向图(社会图): 在此处输入图像描述然后我根据以下代码构建图表: 在此处输入图像描述有没有办法根据进入节点本身的箭头数量来更改节点大小? 不知道如何解决 ...
我正在 R 中构建 a.network。My.csv 输入文件是一个包含多列和多行的列表。 第一列包含边从这些顶点到其他顶点的顶点。 第二列包含第一列顶点的边将到达的顶点。 由于第一列中列出的顶点可能有几条边通往不同的顶点,因此第一列中的顶点包含许多重复项。 但是,在 .network 中它们只会显 ...
我在R中使用 package igraph能够连接到 plot a.network。 但是,当在graph_from_data_frame命令中传递directed = TRUE标志时,它会在 R Studio 的 plot 窗格中准确显示。 但是,一旦我预览为 PDF(导出,另存为 PDF,预览) ...
我想要 plot 一个简单的星图,其中边的大小取决于代表中心节点(例如领导者)和其他节点(例如其员工)之间感知差异的分数。 我成功修改了colors,节点的大小,边缘的宽度但不是后者的大小。 你会怎么做? ...
我想画一个小图增加其fonts的大小。例如,以下代码: 绘制图形 我能够 select 节点标签的字体大小,但我无法指定弧权重的字体大小。 我能怎么做? ...
我有一个在 R 中构建的 igraph.network object 并为每条边生成权重信息。 我想查看权重最大的边(降序)的节点。 我应该使用什么代码来做到这一点? 谢谢! 然后我想看看谁和谁有大量交互(边上权重最大的节点),所以我尝试了 但它没有用。 ...
我在R中使用 package igraph能够连接到 plot a.network。 然而,一旦我在graph function 中传递命令vertex.size ,它会做两件事。 1) 它从 the.network 中删除了一些边和定向箭头 2) 它给了我一个错误: 在 layout[, 2] ...
我正在绘制 a.network 图,但无法读取边缘标签。 有没有办法在边缘标签后面定义背景颜色或不透明区域以使其更具可读性? 谢谢! ...
我正在尝试使用R为igraph上的边和顶点分配相同的颜色渐变。 渐变应在 V(data_graph)$Counts 部分从低计数到高计数着色。 一些可重现的数据: 产生下图: 但是,接下来我想根据V(data_graph)$Counts对顶点和边应用相同的颜色渐变。 我需要的是类似于 ggplot ...
我是 I-graph 的新手。 我想知道。 如何隔离具有特定度值的节点? 如何知道他们的节点ID 我们可以绘制一个度数高于给定阈值的新图吗? 假设节点图的节点 > n? 如果还有更多涉及学位 function 处理的教程/书籍,请告诉我温暖的问候神殿 ...