如果我想为 MPI 程序重新映射 processes-core,我可以在它们生成后迁移吗? 例如:节点 1 有:P0、P3、P6,节点 2 有:P1、P4、P7。 我可以将 P1 迁移到节点 1 吗? 拓扑感知 MPI 建议在研究论文中重新映射。 这暗示了选择一个过程并将其放入提供最佳结果的此类节 ...
如果我想为 MPI 程序重新映射 processes-core,我可以在它们生成后迁移吗? 例如:节点 1 有:P0、P3、P6,节点 2 有:P1、P4、P7。 我可以将 P1 迁移到节点 1 吗? 拓扑感知 MPI 建议在研究论文中重新映射。 这暗示了选择一个过程并将其放入提供最佳结果的此类节 ...
我想找到与 OpenMPI 的--showme标志等效的 mvapich2。 特别是,我正在尝试编译一个我没有在其 local.mk 文件中使用以下代码开发的库: MPI_COMPILE_FLAGS和MPI_LINK_FLAGS被传递给编译必要脚本的 Makefile 的部分。 但是,我没有使用 ...
可以使用MVAPICH2编译fortran 2003程序吗? MVAPICH2 声明 a)提供了自己的编译器,b)提供了mpif77和mpif90包装器(它们均指向/opt/mvapich2-2.3.1/bin/mpifort )。 我找不到任何对此有帮助的文档。 ...
我刚刚在两台计算机上安装了Linux和Intel MPI: (1)非常老(约8年)的SuperMicro服务器,它具有24个内核(Intel Xeon X7542 X 4)。 32 GB内存。 作业系统:CentOS 7.5 (2)新的HP ProLiant DL380服务器,该 ...
我正在使用mvapich2 2.2运行示例程序(hello-world和pi)。 计算后,我看到的信息看起来像是调试(在错误线程中)。 输出线程 错误线程 环境: CentOS 7; Mellanox MT25204; mvapich2-2.2( ...
尽管版本2.3中的mvapich已弃用Nemesis接口,但是现在有什么方法可以立即配置它以支持Infiniband,并在失败时回退到TCP? 还是我必须为网格中的不同网络设置提供两个编译? ...
使用MVAPICH2时,我导出此变量: MV2_USE_LAZY_MEM_UNREGISTER = 0 在用户指南中,此变量定义为: “设置此参数可使mvapich2使用内存注册缓存。” 如果我需要在MPICH中使用此功能,那可能等同于它? ...
我正在尝试优化称为LAMMPS( https://github.com/lammps/lammps )的MPI + CUDA基准测试的性能。 现在,我正在运行两个MPI进程和两个GPU。 我的系统有两个插槽,每个插槽都连接到2个K80。 由于每个K80内部都包含2个GPU,因此每个插槽实际 ...
我有一个在具有以太网和Infiniband连接的计算机群集上运行的MPI程序。 当我使用mpavich2的mpicc进行编译时,它会自动链接到Infiniband库。 编译MPI程序时,有什么方法可以控制使用哪个网络? 我检查了手册页中的mpicc,它对此没有用。 ...
我注意到当我有一个死锁的MPI程序时,例如wait.c 当我使用mvapich2-2.1库(本身使用gcc-4.9.2编译)编译wait.c并运行它(例如mpirun -np 4 ./a.out )时,我注意到(通过top ),所有4个处理器正以100%的比例徘徊。 当我使用ope ...
我在CentOS 7上锁定的页面中的可用内存量有问题。用slurm分配节点后,当我使用MPI(mvapich)启动作业时,遇到以下错误: 这似乎是由于缺少锁定的内存 。 但是,由于ulimit -a返回: 使用sudo启动mpirun时,它正在工作。 ...
我试图弄清楚为什么我的OpenMPI 1.6版本不起作用。 我在CentOS 6.6上使用gcc-4.7.2。 给出一个玩具程序(即hello.c) 并使用mpicc hello.c编译并运行mpirun -np 8 ./a.out ,我得到错误: 如果我使用mvapich2 ...
我目前正在尝试在 CentOS 6 机器上使用 pgcc 15.10 编译 mvapich2-2.1。 我跑 它失败了(不包括大部分诊断输出) 这个问题的解决方案是什么? 我没有使用汇编程序的经验,所以任何提示/建议将不胜感激。 谢谢。 ...
我在Debian 7机器上使用MVAPICH2 2.1。 它有多张Tesla K40m卡。 代码如下。 简而言之,我首先将设备设置为GPU 0,然后发送一些东西。 然后,我将设备设置为GPU 1,发送一些东西。 输出如下。 因此,第一次发送就可以了。 但是,一旦我将 ...
在c ++ / mpi(mvapich)中有一个简单的程序,它发送一个float类型的数组。 当我使用MPI_Send,MPI_Ssend,MPI_Rsend时,如果数据的大小超过了预期的阈值(我的程序中为64k),那么在调用MPI_Send期间我的程序会挂起。 如果array小于阈值,程序 ...
我在超级计算集群(PSB环境)中使用mvapich。 我需要启用MPI_THREAD_MULTIPLE支持才能运行我的程序。 但是我程序的输出表明MPI_Init_thread无法启用MPI_THREAD_MULTIPLE。 PBS脚本是: (最后一行是exe命令。) 我 ...
MVAPICH2可以安装在InfiniBand或其他HPC网络技术以外的普通以太网上吗? ...
我正在尝试在没有MPI_Recv的MPI_Send下测试MPI_Send的效果。 我有以下程序,我使用openmpi-1.4.5和mvapich2-1.9进行编译和运行。 我知道这些实现是针对MPI标准的2个不同版本的,但是我认为MPI_Send和MPI_Recv在这些标准中是相同的: ...
以下链接表示MPICH / MVAPICH中的功能名称前缀约定(例如,MPID和MPIU前缀) MPICH / MVAPICH中的功能名称前缀约定 我只是想知道MPIR前缀代表什么(在上面的链接中没有解释)? 它在哪一层实施,哪些层可以访问? 提前感谢 ...
我想自己编译MVAPICH2,但不确定在哪里可以找到psm.h文件,无法在默认位置找到它。 谁知道我可以使用哪个命令来查找InfiniBand? ...