我在集群上使用mpiexec以使用pyNEST ( mpiexec -n $N python simulate.py pythonsimulate.py ) 运行大规模模拟。 我导出了大量的小文件,这些文件往往会超过我在集群上的 inode 配额。 因此,我试图通过仅允许一个 MPI 进程(“母亲” ...
我在集群上使用mpiexec以使用pyNEST ( mpiexec -n $N python simulate.py pythonsimulate.py ) 运行大规模模拟。 我导出了大量的小文件,这些文件往往会超过我在集群上的 inode 配额。 因此,我试图通过仅允许一个 MPI 进程(“母亲” ...
我正在尝试将spikedetector 数据以二进制格式写入.gdf 文件,但我不能。 我将spikedetector的binary参数设置为True (我使用nest.GetStatus检查了它)但是文件是用ASCII编写的:neurons = nest.Create('iaf_psc_alph ...
在构建和安装过程中很容易忽略 output,所以我想知道 NEST 的 python 模块中是否有办法检查 MPI 集成是否成功? ...
我正在尝试在 NEST 中开发一个简单的代码:一个由 10 个相同的神经元组成的网络,它们之间连接以形成一个循环。 我想使用 arrays 开发此代码,但我收到与参数类型不匹配相关的错误消息。 下面我复制我的代码:# SIMPLE NET -- FIRST TRIAL # First exampl ...
我想在NEST 模拟器(版本 2.20.1)中使用多线程 function 。 但是,它给出了一个警告No multithreading available, using single threading 。 谁能帮我解决它? 我使用 conda 命令安装 NEST 模拟器 下面是我的代码和 out ...
手头的具体问题是: 如何将 NEST 模拟器安装的 nest 模块安装到特定的站点包目录中,例如 pyenv/virtualenv? 但是,当然欢迎在 NEST CMake 本身期间更广泛地解释 Python 模块是如何生成和安装的。 例如,用于安装 Python 文件的setup.py文 ...
在 NEST 模拟器中有虚拟进程的概念。 阅读有关虚拟进程的信息,我希望每个 MPI 进程至少包含 1 个虚拟进程,否则该 MPI 进程什么也不做? 但是,当我启动 4 个 MPI 进程时,内核状态属性total_num_virtual_procs为1 : 这将打印 NEST 导入文本和1 4 ...
有没有办法将 NEST 内核完全重置为您第一次import nest时的原始状态? ...
按照 Python 接口到 NEST 模拟器的教程,我创建了 2 个神经元群并将它们连接起来:import nest ndict = {"I_e": 200.0, "tau_m": 20.0} nest.SetDefaults("iaf_psc_alpha", ndict) neuronpop1 ...
我在 mac 中的 python 版本是 3.8,但我需要 3.7,所以我创建环境 python 3.7,并使用 conda 安装巢。 但是当我导入nest时,仍然出现错误:ModuleNotFoundError: No module named 'nest'。 我检查了python3.7/sit ...
按照Nest模拟器的Ubuntu / Debian安装说明后,我只能在python2.x中导入nest模块,而不是python3.x $ python3 Python 3.6.8 (default, Aug 20 2019, 17:12:48) [GCC 8.3.0] on linux Type ...
我已经安装了 pyNN 和 nest,但我无法导入它。 当我在终端中运行它时,它可以工作,并且程序启动。 但是,如果我尝试在 python 中导入: 它引发了一个错误 我该如何解决? 编辑:我通过自制软件(在 macOS Mojave 上)安装了 pyNN 和 nest。 ...
安装 Nest Neural Simulator 后,在尝试运行安装中提供的任何示例 python 文件时,我不断收到以下错误。 我试过重新安装 Nest、Python 和使用 Anaconda,但没有成功。 蟒蛇错误: 导入错误:没有名为 nest 的模块 建议? ...
我花了一段时间查看有关此错误的其他帖子,但与我安装 Nest 的具体问题无关。 Nest 安装需要 ./configure 来安装,根据 https://nest.github.io/nest-simulator/xcode_workflow 运行 ./configure 时一直出现以下错误: ...
有没有办法禁用从 NEST 生成的输出: 那是由nest.Simulate()生成的吗? ...
所以我昨晚试图安装 nest(和 pynest)以与 PyNN 一起使用,但我目前被卡住了。 当我尝试导入嵌套时,我得到: 但是,当我进行 make installcheck 时,它通过了所有的 pynest 测试。 我使用的是 OS x Yosemite,我使用 macport 重新安装了 p ...
今天我让 PyNest 工作,在我按照他们官方网站上的安装等说明进行操作之后。 我的问题是我必须在成功导入 nest 之前运行以下命令,否则我会收到“ImportError: No module named nest”: 我在上面给你的官方链接上找到了这个命令,但我不明白为什么会发生这种情况。 ...
import nest在$PATH时会给出“没有名为 nest 的模块”错误,这意味着在我的系统$PATH中有一个/opt/nest/lib/python2.7/site-packages: 。 在这个位置有一个名为nest的目录, nest目录内的结构如下所示: ,显然有一个__init_ ...