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我将如何进行元组解包,以便返回的变量根据二维网格中的最近邻居进行配对? - How would I do tuple unpacking such that the returned variables are paired based on being the nearest neighbor in a 2-D grid?

我正在探索您在下图中看到的这些“神经元”之间的神经网络模拟。 我遇到的困难是将每个神经元连接到最近的邻居。 我首先想到我可以通过元组拆包来完成,但是它变得非常复杂。 在这个示例代码片段中,元组解包被配置为使得第i个神经元连接到第i + 1个神经元,直到神经元n 。 当它到达神经元n时,第n个神经元 ...

在神经元模拟器中打开 .hoc 文件+“非机制”问题 - Opening .hoc files in neuron simulator + "not a mechanism" problem

我正在尝试通过 python 运行 NEURON 模拟。 我按顺序获得了所有库,并且能够运行一些简单的模拟,但是在使用更复杂的代码时遇到了一些麻烦。 如果您有任何想法如何提供帮助,我将不胜感激 问题 1 : 即使已编译,Neuron 也不会打开.hoc文件的一部分。 我收到错误: 问题 2: ...

奇点行为:shell vs exec - Singularity behaviour: shell vs exec

因此,我正在尝试调试在我有权访问的 HPC 设置中遇到的错误。 我不会 go 详细介绍错误,因为它是 package 特定的,我很确定这是一个环境变量类型的问题。 这就是说 package 是神经元,如果有人对它和奇点有经验,我会很感激你的意见。 当我使用以下方法在本地测试所有内容时: 没有问题。 ...

为什么在奇异容器中安装主目录会破坏 python 导入? - Why does mounting the home directory in singularity container break a python import?

我一直在构建一个奇点容器来运行一些 python 代码,尽管阅读了奇点文档,但我无法理解错误/行为。 首先,容器是从 docker 引导的 Ubuntu18.04,即: 我需要使用 python 模块(神经元),需要事先编译等。 我在定义文件的%post部分编译代码并添加环境变量: 我可以在没有太 ...

在 Neuron 7.7 中,如何定义模拟的持续时间? - In Neuron 7.7, how to define the duration of a simulation?

在 Neuron 7.5 中,我可以运行一个设置持续时间的模拟,如下所示: 在 Neuron 7.7 中,我收到以下错误: 使用dir似乎没有使用的键仍在h库中,这对于 2 个小版本颠簸(7.5 -> 7.7)来说似乎是一个非常剧烈的变化。 有谁知道如何在 7.7 版中执行此操作? ...

你好在python中不断增加输入的实现 - Hello implementation of continuously increasing input in python

我有一个关于在 FitzHugh-Nagumo model 中展示神经元膜电位的程序中持续增加输入的实现的问题。 我有 model 的结构,但我不知道如何实现不断增加的输入。 根据du/dt的解计算w w2 = b0+b1*v #根据dw/dt的解计算w plot 由 V 和 W 定义的线随时间的 ...

MAC NEURON-Python:错误可以使用更新的命令行工具版本。 通过App Store中的软件更新来更新它们 - MAC NEURON-Python: Error A newer Command Line Tools release is available. Update them from Software Update in the App Store

在尝试使用Python支持安装NEURON时(例如,可以运行python -c "import neuron" ),请使用Human Brain Project门户网站上的说明 。 后: brew install neuron 我收到以下(误导)错误: Error: A new ...

尽管不使用输出,但仍需要存储来自 Python 函数的输出 - Storing output from Python function necessary despite not using output

我试图理解为什么我必须存储 Python 函数的输出(无论我使用的变量名称如何,也无论我随后是否使用该变量)。 我认为这对 Python 更通用,而不是专门用于 NEURON 软件,因此我把它放在 Stackoverflow 上。 感兴趣的线路在这里: 如果我只编写attach_current ...

艾伦大脑研究所 - 大脑观察站示例 - Allen Brain Institute - brain observatory example

我正在尝试遵循大脑天文台 ipython notebook的示例。 但是,我nwb加载如下所示的nwb文件。 所以,我通过HDFview打开了nwb文件。 除了502376461.nwb之外,所有的大脑天文台nwb文件都没有打开。 它抛出了以下错误: 当我尝试在 allen 的 ipy ...


 
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