我正在探索您在下图中看到的这些“神经元”之间的神经网络模拟。 我遇到的困难是将每个神经元连接到最近的邻居。 我首先想到我可以通过元组拆包来完成,但是它变得非常复杂。 在这个示例代码片段中,元组解包被配置为使得第i个神经元连接到第i + 1个神经元,直到神经元n 。 当它到达神经元n时,第n个神经元 ...
我正在探索您在下图中看到的这些“神经元”之间的神经网络模拟。 我遇到的困难是将每个神经元连接到最近的邻居。 我首先想到我可以通过元组拆包来完成,但是它变得非常复杂。 在这个示例代码片段中,元组解包被配置为使得第i个神经元连接到第i + 1个神经元,直到神经元n 。 当它到达神经元n时,第n个神经元 ...
如何使用其 Python 接口在 NEURON 模拟器中创建突触? 我想创建 2 个部分并将它们与突触连接,但在Section API 或部分文档中没有任何功能:from neuron import h src = h.Section(name="source") dest = h.Sectio ...
我正在尝试通过 python 运行 NEURON 模拟。 我按顺序获得了所有库,并且能够运行一些简单的模拟,但是在使用更复杂的代码时遇到了一些麻烦。 如果您有任何想法如何提供帮助,我将不胜感激 问题 1 : 即使已编译,Neuron 也不会打开.hoc文件的一部分。 我收到错误: 问题 2: ...
我寻找正在卸载的 NEURON 模拟器,我发现这篇文章建议删除/usr/local/nrn 。 然后我重复安装 7.7 版本的相同过程,但问题是我还有以前的版本。 我部分按照本教程在 Ubuntu 上安装 package。 我使用 PIP 而不是 anaconda 来安装 python 包。 你有 ...
因此,我正在尝试调试在我有权访问的 HPC 设置中遇到的错误。 我不会 go 详细介绍错误,因为它是 package 特定的,我很确定这是一个环境变量类型的问题。 这就是说 package 是神经元,如果有人对它和奇点有经验,我会很感激你的意见。 当我使用以下方法在本地测试所有内容时: 没有问题。 ...
我一直在构建一个奇点容器来运行一些 python 代码,尽管阅读了奇点文档,但我无法理解错误/行为。 首先,容器是从 docker 引导的 Ubuntu18.04,即: 我需要使用 python 模块(神经元),需要事先编译等。 我在定义文件的%post部分编译代码并添加环境变量: 我可以在没有太 ...
在 Neuron 7.5 中,我可以运行一个设置持续时间的模拟,如下所示: 在 Neuron 7.7 中,我收到以下错误: 使用dir似乎没有使用的键仍在h库中,这对于 2 个小版本颠簸(7.5 -> 7.7)来说似乎是一个非常剧烈的变化。 有谁知道如何在 7.7 版中执行此操作? ...
我有一个关于在 FitzHugh-Nagumo model 中展示神经元膜电位的程序中持续增加输入的实现的问题。 我有 model 的结构,但我不知道如何实现不断增加的输入。 根据du/dt的解计算w w2 = b0+b1*v #根据dw/dt的解计算w plot 由 V 和 W 定义的线随时间的 ...
我已经启动并运行了Visual Studio Community 2019。 我正在尝试将Python与NEURON(7.2.536.15)包一起使用。 我在Python 3.7(64位)环境中安装了Neuron软件包。 如何将神经元模拟器加载到我的Python应用程序中? 命令:i ...
如何更改mod文件中的单位,以便在运行neuoConstract后可以保存单位? 我曾尝试使用Notepad ++进行更改,但是更改无法下次保存。 ...
在尝试使用Python支持安装NEURON时(例如,可以运行python -c "import neuron" ),请使用Human Brain Project门户网站上的说明 。 后: brew install neuron 我收到以下(误导)错误: Error: A new ...
我试图理解为什么我必须存储 Python 函数的输出(无论我使用的变量名称如何,也无论我随后是否使用该变量)。 我认为这对 Python 更通用,而不是专门用于 NEURON 软件,因此我把它放在 Stackoverflow 上。 感兴趣的线路在这里: 如果我只编写attach_current ...
我已经下载了艾伦神经元模型:Nr5a1-Cre VISp层2/3 473862496 使用所有必需的软件包安装Anaconda并安装NEURON: https ://alleninstitute.github.io/AllenSDK/install.html 现在,我如何使用alle ...
我正在尝试遵循大脑天文台 ipython notebook的示例。 但是,我nwb加载如下所示的nwb文件。 所以,我通过HDFview打开了nwb文件。 除了502376461.nwb之外,所有的大脑天文台nwb文件都没有打开。 它抛出了以下错误: 当我尝试在 allen 的 ipy ...
如何将LEMS中的以下标签映射到NEURON .MOD / NMODL文件中: ...
NEURON .MOD / NMODL文件节中的命令以什么顺序执行? 具体来说,在以下块中:DERIVATIVE,BREAKPOINT和NET_RECEIVE。 ...
调试NEURON模拟器.MOD文件有哪些有用的方法? 在其他语言中,通常可以使用print()语句查看变量值。 .MOD文件中是否有类似print()语句的内容? ...
是否有某种事件机制可以让我知道模拟是否已完成? 我有一个在NEURON中模拟的LEMS文件,其中: jnml LEMS_file.xml -neuron -run 模拟完成后,GUI保持打开状态。 ...
在NEURON模拟器中,除了单独遍历每个属性之外,还有一种更简便的方法来列出节的属性吗? ...
当为NEURON使用python接口时,当我在python中使用g.addvar(...)创建g=h.Graph()对象以绘制变量时,单击Init&Run会生成一个空的Graph: ...