通过Matlab和Java驱动程序从MongoDB（gridfs）读取数据

Question

我正在使用Matlab和Java驱动程序。 将一些大数据写入数据库后，我想稍后再读取它们。 这些文件大约有100MB，因此我将它们写入GridFS。

我通过以下方式将Java驱动程序中的数据读取到Matlab中：

dbgridfs = GridFS(db, 'data_gridfs');
file1 = dbgridfs.findOne('bigdata');

在该代码之后，我将在Matlab工作区中获得一个对象：名称大小字节类File1 1x1 com.mongodb.gridfs.GridFSDBFile

现在，我遇到了将（Java？）对象转换为nativ Matlab变量的问题。

我在不同的网站上搜索了很多，但没有得到。 目前，我正在将数据写入硬盘，然后将其读入本地Matlab变量中-但这是一种非常肮脏的方式，不要问我有关性能的问题:(

我是否缺少使用Java驱动程序的现有解决方案，并且/或者您知道一些可以帮助我的代码吗？ 谢谢你的帮助。

关于马特

Answer 1

我从未回答过任何论坛问题，但特别是从stackoverflow中受益匪浅，因此我认为我必须至少回馈一次。 由于上述问题现在困扰着我近两天，因此我最终找到了解决方案，我认为这是一个回馈社区的好话题。

我遇到了使用Java驱动程序从MongoDB / GridFS检索图像（.png）的相同问题。 首先，如上所述，您需要检索文件Java对象：

    import com.mongodb.*;
    import com.mongodb.gridfs.*;

    mongoClient = MongoClient('server_name',27017);
    db = mongoClient.getDB('database_name');
    imgData = GridFS(db,'image_data');

上面的代码部分将获取带有图像数据的集合。 之后，可以检索图像数据Java对象：

    javaIObj = imgData.findOne('image_name.png');

现在需要ByteArrayOutputStream，可以在其中将数据流而不是文件通过管道传输到其中：

    import java.io.ByteArrayOutputStream;

    baos = ByteArrayOutputStream();
    javaIObj.writeTo(baos);

需要再次将输出流传递到ByteArrayInputStream中，该ByteArrayInputStream可用于构造ImageIO对象：

    import java.io.ByteArrayInputStream;
    import javax.imageio.ImageIO;    

    bais = ByteArrayInputStream(baos.toByteArray());
    jbi = ImageIO.read(bais);

现在可以检索和显示实际的Matlab图像作为矩阵：

    nrows = jbi.getHeight; ncols = jbi.getWidth;
    data = jbi.getData.getPixels(0,0,ncols,nrows,[]);
    matImg = reshape(data,ncols,nrows)';

    imagesc(matImg);

我不知道这是否是完美的解决方案，但是它对我有用。

干杯!