如何将ROI合并到imageJ插件中？

Question

我是java的新手，所以如果这是一个愚蠢的问题，请原谅我！

我正在编写与我的项目相关的插件，以帮助我学习用于图像分析的Java /编写插件，并且本质上是想将我要进行的测量限制为ROI / Overlay，但并不完全确定该怎么做。

我目前的第一步是创建一个float数组来存储像素值，如下所示：

float []像素=新的float [宽度*高度* nChannels * nSlices * nFrames]；

（通过以下步骤适应堆栈，多个通道等）。

到目前为止，它可以很好地完成我想做的事情，但是我不确定如何使它适应于包含/工作于ROI而不是整个图像。 该插件旨在从控制图像中提取不同类型的值（例如，均值，最大值，中位数等）。

有什么建议么？ 帮助将不胜感激！ 谢谢！

Answer 1

请注意，在不完全知道您要做什么的情况下，很难给出具体的建议。 通常，您可以使用RoiManager查询可用的Rois ，然后将其用于访问像素。

但是，看到手动构造一个float[]来存储像素（而不是ImagePlus ）使我有些紧张。 由于您是Java的新手，因此建议您查看ImageJ Wiki ，尤其是ImageJ API的概述 。 它确实讨论了感兴趣的区域 。

您可能还会发现以下资源特别有用：

• 邮件列表 -有关图像分析技术和插件设计的建议
• 斐济食谱 -引导您了解许多插件示例
• ImageJ javadoc -API的技术规范