控制ImageJ的现有实例

Question

首先，我不太熟悉Java。 实际上，我正在使用JLink / Mathematica做我想做的事情。

在我们的实验室中，我们正在使用Mathematica控制的相机为实验拍照。 我们想将图像显示程序转换为ImageJ。 另一个程序是内存占用器，它很慢。

通过研究，我可以通过编写插件，脚本或宏来实现这一目标。 我的印象是，我写的任何东西都将安装到ImageJ中并由默认GUI控制。

我的问题是，我可以编写一个外部程序来控制已经运行的ImageJ实例吗？ 理想情况下，事件的顺序应该是。

1. 相机通过已经存在的脚本捕获图像。
2. 图像捕获脚本要求ImageJ显示捕获的图像以及默认的GUI，以便我可以访问默认的工具集。
3. 我可以通过默认GUI进行一些剖面图和直方图。
4. 将图像移交给ImageJ的脚本已关闭，但是ImageJ上的图像仍然保留。

我已成功导入ImageJ的ij类并进行了使用。 这是我在ImageJ中创建图片的尝试。 它在Mathematica的JLink中，但可以相当地翻译成Java。

Needs["JLink`"];
InstallJava[];
AddToClassPath["C:\\Program Files\\ImageJ\\ij.jar"];
ijClass = LoadJavaClass["ij.IJ"];
imagePlusClass = LoadJavaClass["ij.ImagePlus"];
JavaNew[imagePlusClass, "My New Image", 
  JavaNew["ij.process.ByteProcessor", 400, 400]]@show[]
ij`IJ`log["test"];
ij`IJ`getLog[]

但是，创建的图像位于某种Java窗口中。 已经运行的imageJ根本不与之交互。 此外，我似乎可以使用getLog []捕获已经运行的ImageJ的日志。

再次，问题是，我可以使用未在ImageJ中安装的外部脚本作为插件，脚本或宏来在已经运行的ImageJ上显示图像吗？ 另外，是否可以使用外部脚本在已经运行的ImageJ实例上调用预安装的宏？

Answer 1

您尝试执行的操作称为进程间通信 。 ImageJ具有将信息传递到正在运行的实例的机制。 转到编辑▶选项▶杂项...，然后选中“运行单实例侦听器”框。 但是，此功能仅限于命令行参数。 因此，您可以通过尝试启动具有所需参数的第二个ImageJ（例如，然后将其传递到运行的实例）来告诉正在运行的实例从磁盘打开映像。 但是您不能直接在电线上馈送像素-您必须将它们写入临时文件。

您最简单的选择是通过ImageJ进行所有操作。 但这并不是将当前的方案与Mathematica混合在一起的最简单的转变。

因此，下一个最简单的事情是从Mathematica启动ImageJ，并始终与该ImageJ的同一实例通信以完成所有操作。 也许你可以做到？

如果必须与外部启动的ImageJ实例进行通信，则需要使用上面提到的CLI参数传递方案，或者实现自己的某种进程间通信方案 。