openmpi + java，找不到或加载主类

Question

我最近正在尝试openmpi库的java绑定：

我已经使用以下配置成功编译了lib：

$/configure --prefix "/home/yuechuan/Application/.openmpi" --enable-mpi-java --with-jdk-dir="/usr/lib/jvm/java-8-oracle/" --with-jdk-header="/usr/lib/jvm/java-8-oracle/include/"

$sudo make install

我可以使用以下命令编译一个简单的Java程序： $mpijavac src/com/cyc115/pa2/Main.java

当前$echo $CLASSPATH给出/home/yuechuan/Github/parallel_pa2/src/com/cyc115/pa2/

但是，我无法让类文件运行。 到目前为止，我尝试了一些替代方法：

$java -Djava.library.path=/home/yuechuan/Application/.openmpi/lib/mpi.jar -cp .:/home/yuechuan/Application/.openmpi/lib/mpi.jar Main

返回Error: Could not find or load main class Main错误。

简单的$java Main命令返回NoClassDefFoundError

Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again
Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: mpi/MPIException
    at java.lang.Class.getDeclaredMethods0(Native Method)
    at java.lang.Class.privateGetDeclaredMethods(Class.java:2701)
    at java.lang.Class.privateGetMethodRecursive(Class.java:3048)
    at java.lang.Class.getMethod0(Class.java:3018)
    at java.lang.Class.getMethod(Class.java:1784)
    at sun.launcher.LauncherHelper.validateMainClass(LauncherHelper.java:544)
    at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(LauncherHelper.java:526)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: mpi.MPIException
    at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:381)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:424)
    at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:331)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:357)
    ... 7 more

如果有人需要，这是java文件：

package com.cyc115.pa2;

import mpi.MPI;
import mpi.MPIException;

public class Main {

    public static void main(String args[]) throws MPIException
    {
        MPI.Init(args);

        int rank = MPI.COMM_WORLD.getRank();
        int size = MPI.COMM_WORLD.getSize();

        System.out.print("hello world");
        MPI.Finalize();
    }
}

关于如何使.class运行的任何想法？

Answer 1

由于包装是：

package com.cyc115.pa2;

您需要将文件Main.java放在名为com/cyc115/pa2的子目录中libmpi_java.so库路径应该是包含libmpi_java.so的目录的路径，而不是libmpi_java.so的路径。

编译：

javac -cp /home/yuechuan/Application/.openmpi/lib/mpi.jar com/cyc115/pa2/Main.java 

跑步：

java -Djava.library.path=/home/yuechuan/Application/.openmpi/lib/ -cp .:/home/yuechuan/Application/.openmpi/lib/mpi.jar com.cyc115.pa2.Main

以下不是问题，仅是仅供参考：

它应该是--with-jdk-headers和s，而不是--with-jdk-header但是如果您已经指定了--with-jdk-dir则不必完全指定它。