是否有比LibTIFF更快的方法从32位tiff中提取浮点数？

Question

我目前正在使用它来提取浮点数：

TIFF* tiff = TIFFOpen(tiffs[i].c_str(), "r");
if (tiff) {
    uint32 width, height;
    tsize_t scanlength; 
    if (TIFFGetField(tiff,TIFFTAG_IMAGEWIDTH, &width) != 1) {}
    if (TIFFGetField(tiff,TIFFTAG_IMAGELENGTH, &height) != 1) {}
    fwidth = width;
    fheight = height;
    vector<float> data;
    scanlength = TIFFScanlineSize(tiff);
    float image[height][width];
    for (uint32 y = 0; y < height; y++) {
        TIFFReadScanline(tiff,image[y],y);
    }
}

每个TIFF花费超过0.02秒，我需要更快。 我知道，其他库可以种处理这个问题，但我只找到一个其他的可以处理32位TIFF格式，它是CIMG，历时程较长。 即使这就像使用system()来执行命令行或调用一个真正快速的脚本那样简单，我也很想知道是否有一种更快的方法。

谢谢！

https://www.dropbox.com/s/5zb8spaz7cma1gx/pic.tif?dl=0

这是一个例子。

Answer 1

嗯，答案还不尽如我所愿，但我确实有一些想法要分享。 也许他们会引起我或其他人的进一步思考。

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首先，您的图像缺少TIFF标签262（ “光度解释” ），这会打乱您可能会使用的几种工具。 图像由什么程序生成-由于它们不严格兼容？ 您可以更正/改善生成图像的程序吗？

我设法通过以下方法将“光度学解释”标签设置为“ min-is-black” ：

tiffset -s 262 0 YourImage.tif

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设置好之后，我设法使用了vips （从这里开始） -非常快，而且内存高效，可以将文件转换为JPEG。 如果您喜欢这些语言，它具有Ruby和Python绑定。

因此，终端中用于将文件转换为JPEG的命令行为：

vips im_vips2jpeg YourFile.tif result.jpg

我不相信，虽然可以正常工作，所以也许约翰@ user894763（笔者vips ）将看一看。

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使用vips另一种想法是，以下命令将保存每个像素3个浮点的RGB原始文件，您可以将其直接读取到自己的程序中，而无需任何解码：

vips rawsave YourFile.tif image.raw

-rw-r--r--   1 mark  staff  3145728 20 Jun 16:59 image.raw

您会注意到文件大小（3145728）对应于：

512 pixels * 512 pixels * 3 RGB values * 4 bytes of float each

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我还使用ImageMagick将图像转换为JPEG

convert YourImage.tif result.jpg

并得到以下结果：

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我想到的另一种想法是，您可以在运行自己的TIFF提取程序之前预热缓冲区缓存，方法是在每个文件上运行cat以使它们从NFS服务器中获取：

cat *.tif > /dev/null

或运行并行流以减少延迟。

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另一个想法是，您可以将文件预取到RAM支持的文件系统中，以便可以以最小的延迟读取文件。 每个文件186kB，您可以在1GB RAM磁盘中获得5,000，以进行更快的处理：

mkdir /tmp/RAM
sudo mount -t temps -o size=1G temps /tmp/RAM

您也可以将我在上面的想法中建议的中间文件放入RAM文件系统。