如何通过参数传递数据在HPC集群上执行Matlab程序？

Question

我有一个需要在HPC群集上运行的MATLAB程序。 我想做的是通过在参数中传递数据来运行程序。

addpath('path')
savepath 

% a and b need to be passed through an argument
c = addition(a,b);

fileID=fopen('test.txt','w');
fprintf(fileID,'Num\n');
fprintf(fileID,'%f\n',c);
fclose(fileID);

我有两个问题：1.如何编写参数以传递数据？ 2.如何在MATLAB中编写代码以获取从参数传递的数据？

先感谢您。

Answer 1

您可以使用自己的参数编写一个Matlab m文件脚本（例如，此处名为mymfile.m ），然后在群集上运行该脚本（具体取决于您的群集，可能需要使用Shell脚本来启动它）

matlab -r mymfile.m

（请注意，只能像这样运行脚本，不能运行Matlab 函数 （尽管可以从脚本中调用函数））。 或者，您也可以显式地运行纯命令

matlab -r 'addpath('path'),savepath,c=addition(a,b); ... , exit' 

您可能会在shell脚本中传递a和b 。 如果您使用Linux集群/服务器，并且要执行同一Matlab脚本的多个参数运行，则可以使用xargs 。