[英]DICOMDir file getting corrupted after save with fo-dicom
我在将文件添加到DICOMDir时遇到问题。 基于此示例,我成功创建了一系列图像并将其保存到磁盘。 然后,我尝试将该文件添加到DICOMDIR,以便Dir引用新文件,并且尽管保存成功,但是当我尝试再次打开DICOMDir及其系列时,我得到一个“标记:(0088,0200 )在数据集中找不到”)。
代码如下:
var dataset = new DicomDataset();
this.FillDataset(dataset); //this function copies several Tag values of an already existing DICOM Series file, such as Patient information
dataset.Add(DicomTag.PhotometricInterpretation, PhotometricInterpretation.Rgb.Value);
dataset.Add(DicomTag.Rows, (ushort)rows);
dataset.Add(DicomTag.Columns, (ushort)columns);
var pixelData = DicomPixelData.Create(dataset, true);
pixelData.AddFrame(buffer);
var dicomfile = new DicomFile(dataset);
var pathImage = Path.Combine(dirImages.FullName, imageFileName);
dicomfile.Save(pathImage); //Image is saved fine and it's well formed, I've checked opening it with an online DICOM viewer
var dicomdirPath = Path.Combine(studyPath, Constants.DICOMDIRFileName);
var dicomdir = DicomDirectory.Open(dicomdirPath);
dicomdir.AddFile(dicomfile, $@"Images\{imageFileName}");
dicomdir.Save(dicomdirPath); //this executes without problems and the DICOMDIR is saved
这是系列的打开方法:
var dicomDirectory = await DicomDirectory.OpenAsync(dicomdirPath);
foreach (var patientRecord in dicomDirectory.RootDirectoryRecordCollection)
{
foreach (var studyRecord in patientRecord.LowerLevelDirectoryRecordCollection)
{
foreach (var seriesRecord in studyRecord.LowerLevelDirectoryRecordCollection)
{
foreach (var imageRecord in seriesRecord.LowerLevelDirectoryRecordCollection)
{
var dicomDataset = imageRecord.GetSequence(DicomTag.IconImageSequence).Items.First(); //This line works fine before saving the image in the method above, but throws when opening the same study
//Load data and series from dataset
}
}
}
}
我不知道是否丢失了有关保存DICOMDir文件的内容,或者是否出错。
您尝试访问显然不存在的IconImageSequence(0088,0200)。 DicomDir仅包含图像的一些主要数据。 将图像添加到dicomdir时,由您决定是否要添加其他信息。 图标是fo-dicom不会自动添加的那些可选信息之一。 DicomDir允许包含一个小图标,以显示是否要快速显示一些预览。
实际上, imageRecord
应该包含您可能需要的所有信息,例如instanceuid或filename等。
我不知道为什么在使用fo-dicom存储文件之前代码行运行良好。 我假设已经使用其他包含Icon的应用程序创建了DICOMDIR? 然后当您到达新添加的条目时,foreach崩溃。
您可以在将新实例添加到DICOMDIR时自己添加一个Icon,也可以添加“ if imageRecord.TryGetSequece(iconImageSequence,out seq)..”之类的检查以处理没有图标的情况。
我建议还是添加检查,因为有一天您可能会阅读DICOMDIR并参考一些结构化报告,并且那些结构化报告没有像素数据,因此不会包含图标。
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