如何在C ++中逐行读取.gz文件？

Question

我有3 TB的.gz文件，想要在C ++程序中逐行读取其未压缩的内容。 由于文件非常庞大，我想避免将其完全加载到内存中。

任何人都可以发布一个简单的例子吗？

Answer 1

您最有可能必须使用ZLib的deflate，例子可以从他们的网站获得

或者你可以看看BOOST C ++包装器

来自BOOST页面的示例（解压缩文件中的数据并将其写入标准输出）

#include <fstream>
#include <iostream>
#include <boost/iostreams/filtering_streambuf.hpp>
#include <boost/iostreams/copy.hpp>
#include <boost/iostreams/filter/zlib.hpp>

int main() 
{
    using namespace std;

    ifstream file("hello.z", ios_base::in | ios_base::binary);
    filtering_streambuf<input> in;
    in.push(zlib_decompressor());
    in.push(file);
    boost::iostreams::copy(in, cout);
}

Answer 2

对于将要定期使用的内容，您可能希望使用之前的建议之一。 或者，你可以做到

gzcat file.gz | yourprogram

并有yourprogram可以从cin读取。 这将解压缩，因为它需要内存中的文件的部分，以及未压缩输出发送到yourprogram 。

Answer 3

使用zlib ，我正在做这些事情：

// return a line in a std::vector< char >
std::vector< char > readline( gzFile f ) {
    std::vector< char > v( 256 );
    unsigned pos = 0;
    for ( ;; ) {
        if ( gzgets( f, &v[ pos ], v.size() - pos ) == 0 ) {
            // end-of-file or error
            int err;
            const char *msg = gzerror( f, &err );
            if ( err != Z_OK ) {
                // handle error
            }
            break;
        }
        unsigned read = strlen( &v[ pos ] );
        if ( v[ pos + read - 1 ] == '\n' ) {
            if ( pos + read >= 2 && v[ pos + read - 2 ] == '\r' ) {
                pos = pos + read - 2;
            } else {
                pos = pos + read - 1;
            }
            break;
        }
        if ( read == 0 || pos + read < v.size() - 1 ) {
            pos = read + pos;
            break;
        }
        pos = v.size() - 1;
        v.resize( v.size() * 2 );
    }
    v.resize( pos );
    return v;
}

编辑：在上面的示例中删除了两个错误复制的* 。 编辑：修正了v [pos + read - 2]上读取的界限

Answer 4

zlib库支持以块为单位解压缩内存中的文件，因此您无需解压缩整个文件即可对其进行处理。

Answer 5

你不能这样做，因为* .gz没有“行”。

如果压缩数据有换行符，则必须对其进行解压缩。 您不必一次解压缩所有数据，您知道，您可以在块中执行此操作，并在遇到换行符时将字符串发送回主程序。 * .gz可以使用zlib解压缩。

Answer 6

以下是一些代码，您可以逐行读取普通文件和压缩文件：

char line[0x10000];
FILE *infile=open_file(file);
bool gzipped=endsWith(file, ".gz");
if(gzipped) 
    init_gzip_stream(infile,&line[0]);
while (readLine(infile,line,gzipped)) {
    if(line[0]==0)continue;// skip gzip new_block
    printf(line);
}


#include <zlib.h>
#define CHUNK 0x100
#define OUT_CHUNK CHUNK*100
unsigned char gzip_in[CHUNK];
unsigned char gzip_out[OUT_CHUNK];
///* These are parameters to inflateInit2. See http://zlib.net/manual.html for the exact meanings. */
#define windowBits 15
#define ENABLE_ZLIB_GZIP 32
z_stream strm = {0};
z_stream init_gzip_stream(FILE* file,char* out){// unsigned     
        strm.zalloc = Z_NULL;
        strm.zfree = Z_NULL;
        strm.opaque = Z_NULL;
        strm.next_in = gzip_in;
        strm.avail_in = 0;
        strm.next_out = gzip_out;
        inflateInit2 (& strm, windowBits | ENABLE_ZLIB_GZIP);
    return strm;
}

bool inflate_gzip(FILE* file, z_stream strm,size_t bytes_read){
            strm.avail_in = (int)bytes_read;
            do {
                strm.avail_out = OUT_CHUNK;
                inflate (& strm, Z_NO_FLUSH);
//              printf ("%s",gzip_out);
            }while (strm.avail_out == 0);
            if (feof (file)) {
                inflateEnd (& strm);
                return false;
            }
    return true;// all OK
}


char* first_line=(char*)&gzip_out[0];
char* current_line=first_line;
char* next_line=first_line;
char hangover[1000];
bool readLine(FILE* infile,char* line,bool gzipped){
    if(!gzipped)
        return fgets(line, sizeof(line), infile) != NULL;
    else{
        bool ok=true;
        current_line=next_line;
        if(!current_line || strlen(current_line)==0 || next_line-current_line>OUT_CHUNK){
            current_line=first_line;
            size_t bytes_read = fread (gzip_in, sizeof (char), CHUNK, infile);
            ok=inflate_gzip(infile,strm,bytes_read);
            strcpy(line,hangover);
        }
        if(ok){
            next_line=strstr(current_line,"\n");
            if(next_line){
                next_line[0]=0;
                next_line++;
                strcpy(line+strlen(hangover),current_line);
                hangover[0]=0;
            }else{
                strcpy(hangover,current_line);
                line[0]=0;// skip that one!!
            }
        }
        return ok;
    }
}

Answer 7

Chilkat（ http://www.chilkatsoft.com/ ）具有从C ++，。Net，VB，...应用程序读取压缩文件的库。