使用biojava将文本文件读取到JTable的特定列的步骤

Question

这是一个典型的输入.txt文件（也称为fasta文件）：

>contig00001  length=586   numreads=4
CGGGAAATTATCcGCGCCTTCACCGCCGCCGGTTCCACCGACGAACGGATACTGCGtGaa
ggCCGCGATCCCGTCggaCGGAAAaCGCCcTGGCCCGGGAaCATACCGTTCGGGCCGCCA
AGTGTTATAGCCGGACCACTTGTCAGAACATTTCCaaTCCGAAGATGTGAGTtCGGAAGg
TAAAAGCCCGACAAGTTGCGCGgTGAATTTACCTTtACcGCACGATATGCGTCCGTATTA
AaGAAAaGTTCGAAATTATCAGTAAGGCCGACCTGAAaGCTGACCGGGAGTTCAACAAAA
TCTGCATCACCcGGgTCACGGTCGAAATTGCTGTACGCGGCGCTGAACGTAAATTCACCC
TTTcTAAGGGTGTCGCcGTCGTAAACCGTAAaCAaGCCGGTAGCGCCGCCCATCGGGCCG
CCGGTACCAACCGTCGGTGCCGTGTTTCTtGCATCATTGTCCGATCGAGCGTTCTCGTCC
GCTTGTGCAAaTCCTGCAaTAGCTAACGTGAAAACGATCAGAGCTGTTGTAAATACTCTA
TAAGCGAGATTCATCACATTCCTCcGCCGAAATAAAAAGTTAATTt

>contig00002  length=554   numreads=4
TGCGCCAaCCGCGCTCTtCATAAaTGGGCACTGCTCCCGATGGCCgACTCGGGCGGTTCG
CCATGAGATCTTTGCCtACCcAGgAaCtCACcACCAAGTCTGATTGCTGTGTGTTTtCTT
CAAGTCCCTATTTCTATTCtCTTtAATGGAACCCGTAGGAAACCCGTGTAGGACGCGGGA
aCCGCACTTgAAGGGGGAGGCGCGGGGTACCGGtCCGGGAACGTACGGGTACCGGCGGGG
gAGGGGAGGGGGACCgCTCCGGGAAGGCCAGGGGACGGATTGGGGAAGGgCGGGTACCGA
AGCGGGgAAaTGGGggAaCcGGCGAGAGGGTTCCTCGCTAAGTGGGGGAAATaGGGGAAA
GGTTGACCAGTGGTtCCCcGCTCTCGTAACATGCCTCAGATAGCGCCATCCGCTGTACCT
GGtcaggtcGctggcaacttcggccgagcaggtgaacccgaaaggtgagggtcagtgtga
cacaccaaccgaacaccgacgaggcaagcgtaggagccggcgtggccgcgcccggcggcg
ctgaggactcctcg

可以在此处找到读取序列的代码。

它给出了正确的输出，如下图所示，带有标签分隔：

contig00001   586   52.38
contig00002   554   62.45

问题是我在NetBeans中开发了一个由具有5列的JTable组成的表单，即：

"contigID","Description","Organism","Sequence_length","Gc_percentage" 

和一个JTextArea 。 我想在JTable列中显示上面的输出，而其他列保持为空; 当我点击JTable 'contig00001'时，应该在JTextArea显示类似“CGGGAAAT ....”的序列。

我怎样才能做到这一点？ 任何建议将不胜感激。

Answer 1

一种方法是扩展AbstractTableModel ，如创建表模型中所述 。

附录：通过监听用户选择 ，您可以确定选择了哪一行并相应地更新您的JTextArea 。

附录：由于数据检索可能会受到影响，因此SwingWorker提供了一种安全的方法来改变TableModel 。 这是一个简单的例子 。

Answer 2

我不确定你坚持的是什么。 如果它正在向JTable添加数据，我会考虑创建一个DefaultTableModel对象，使用数组中正确的列标题字符串构造它，包含0行数据，然后在读取文件时添加数据行。 JTable教程应该可以帮助您完成所有这些工作。 创建表模型后，可以通过setModel方法轻松将其添加到JTable中。