从Prefuse图中删除节点

Question

我正在尝试创建动态更新的Prefuse图，其中定期添加和删除节点。 我已经能够很好地添加节点和边，然后删除它们，但是当我尝试将边添加到下一组节点时，我得到了例外。 有人知道从Prefuse图中删除节点有什么陷阱吗？ 或者，没有人知道更好的与Prefuse图动态交互的方法吗？

（请注意，显示正在良好地更新；在任何时候，显示似乎都与图的内容匹配。这并不是Prefuse Toolkit的复制品：动态添加节点和边 ）

代码摘录：

// Set up edge and node tables
Schema node_schema = new Schema();
Schema edge_schema = new Schema();
node_schema.addColumn("node_info", NodeInfo.class);
edge_schema.addColumn("source", int.class, 0);
edge_schema.addColumn("target", int.class, 0);
edge_schema.addColumn("edge_info", EdgeInfo.class);
graph_nodes = node_schema.instantiate();
graph_edges = edge_schema.instantiate();

...

// Set up visualization
graph = new Graph(graph_nodes, graph_edges, false);
vis_panel = new MyVisPanel(graph);

...

// Add nodes & edges
int new_node_1 = graph_nodes.addRow();
graph_nodes.set(new_node_1, "node_info", new NodeInfo());
int new_node_2 = graph_nodes.addRow();
graph_nodes.set(new_node_2, "node_info", new NodeInfo());
int new_edge = graph_edges.addRow();
graph_edges.set(new_edge, "target", new_node_1);
graph_edges.set(new_edge, "source", new_node_2);

... 

// Remove nodes
TupleSet nodes = graph.getNodes();
Iterator iter = nodes.tuples(my_predicate);
while(iter.hasNext())
{
    int row_to_delete = ((Tuple) iter.next()).getRow();
    if(graph.removeNode(row_to_delete))
    {
        System.out.println("Removed row " + row_to_delete);
    }
}

...

// Add nodes & edges again
int new_node_1 = graph_nodes.addRow();
graph_nodes.set(new_node_1, "node_info", new NodeInfo());
int new_node_2 = graph_nodes.addRow();
graph_nodes.set(new_node_2, "node_info", new NodeInfo());
int new_edge = graph_edges.addRow(); // <<-- Exception is thrown here
graph_edges.set(new_edge, "target", new_node_1);
graph_edges.set(new_edge, "source", new_node_2);

我得到的异常是：

java.lang.IllegalArgumentException: Row index out of bounds: -1
    at prefuse.data.column.IntColumn.getInt(Unknown Source)
    at prefuse.data.Table.getInt(Unknown Source)
    at prefuse.data.Graph.updateDegrees(Unknown Source)
    at prefuse.data.Graph.updateDegrees(Unknown Source)
    at prefuse.data.Graph$Listener.tableChanged(Unknown Source)
    at prefuse.data.Table.fireTableEvent(Unknown Source)
    at prefuse.data.Table.addRow(Unknown Source)
    at my_pkg.addSomeNodesFunction(my_code.java:99)

我没有使用标准的Graph.addNode（）和addEdge（）方法，因为用这种方法设置边缘信息似乎更加困难。 （如果有更好的方法，请告诉我！）删除成功，因为在删除节点之后，graph.getNodeCount（）和graph.getEdgeCount（）返回的数字较小。

有任何想法吗？

Answer 1

经过更多调查后，这似乎是一个很小的错误。 调用addEdge首先将源和目标节点号初始化为0，此后图形尝试更新其度数计数，如果节点0不存在则失败。 有关更多信息，请参见其 SF页面上的错误报告3529747 。