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c ++ 11和MPI库的兼容性

[英]compatibility of c++11 and MPI library

在我的linux中安装gcc和mpich库后,我可以使用mpicxx编译器编译我的代码。 是否可以将c ++ 11与mpi库一起使用,只需升级gcc编译器?

没有问题,因为你不应该以任何方式篡改MPI指令,除此之外,MPI和C ++ 11的问题是正交的。

顺便说一下,在我的机器上发出mpic++mpicxx (gcc 4.6.3,MPICH2 1.4.1)只需转换成

c++ -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -I/usr/include/mpich2 -L/usr/lib -lmpichcxx -lmpich -lopa -lmpl -lrt -lcr -lpthread

您可以使用mpic++ -show在自己的机器上检查。

除非观察到一些强大的代码生成更改(例如,不同的数据对齐或不同的ABI),否则使用较新版本更改编译器应该可以正常工作。 MPI是一个库,因此它不关心你使用的是什么语言结构,只要这些结构不会弄乱它的内部结构。 由于您将使用C ++ 11来提供它提供的线程,因此您应该注意一些事项。

首先,多线程并不总是与MPI很好。 大多数MPI实现都是内部线程化的,但默认情况下不是线程安全的。

其次,MPI定义了四个级别的线程支持:

  • MPI_THREAD_SINGLE :没有线程支持 - 只有在单线程应用程序使用时,MPI才能安全运行;
  • MPI_THREAD_FUNNELED :部分线程支持 - MPI可以在多线程应用程序中使用,但只有主线程可以调用MPI;
  • MPI_THREAD_SERIALIZED :部分线程支持 - MPI可以在多线程应用程序中使用,但不允许在不同线程中进行并发调用。 也就是说,每个线程都可以调用MPI,但必须有一个序列化机制;
  • MPI_THREAD_MULTIPLE :完全线程支持 - 可以从许多线程中自由调用MPI。

真相是大多数MPI实现支持MPI_THREAD_FUNNELED ,其中大多数只支持MPI_THERAD_SINGLE 例如,打开MPI必须使用非默认选项进行编译,以获得完整的线程支持。

多线程应用程序应该初始化使用MPI库MPI_Init_thread()代替MPI_Init()这让初始化呼叫变成主线程的线程-即只允许在支持的级别被调入MPI非常相同的主线程 MPI_THREAD_FUNNELED 一个给MPI_Thread_init() 所需的线程支持级别,该函数返回可能低于所需的支持级别。 在后一种情况下,正确的和可移植的程序应该相应地起作用,并且切换到非线程操作或者用相应的错误消息中止到用户。

有关MPI如何与线程协同工作的更多信息,请参阅MPI标准v2.2

将C ++ 11与MPI结合起来没有问题。

mpic ++和mpicxx只是包装器,使用标准编译器或用户指定的编译器。 因此,您可以定义mpic ++和mpicxx使用与C ++ 11兼容的编译器。

我不知道mpich的确切命令。 对于opemmpi,您需要设置这些环境标志:

export OMPI_CC='gcc-mp-4.7'
export OMPI_CXX='g++-mp-4.7'

在我的例子中,我使用openmpi 1.5.5和macports的gcc 4.7编译器。

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